Changeset 8416 for mauRepo/MolesManager


Ignore:
Timestamp:
27/06/12 16:41:44 (7 years ago)
Author:
mnagni
Message:

Incomplete - # 22488: CEDA Observation Collection - Geographical Extent
 http://team.ceda.ac.uk/trac/ceda/ticket/22488

Location:
mauRepo/MolesManager/trunk/src
Files:
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • mauRepo/MolesManager/trunk/src/MolesManager/moles3epb.py

    r8409 r8416  
    4141from ea_model.iso_19115_2006_metadata_corrigendum.citation_and_responsible_party_information.ci_citation import CI_Citation 
    4242from ea_model.iso_19115_2006_metadata_corrigendum.extent_information.ex_geographicboundingbox import EX_GeographicBoundingBox 
    43 from libs.postgisutil import unifyGeometries, create_st_setSRID 
     43from libs.postgisutil import unifyGeometries, create_st_setSRID, getBox2D,\ 
     44    unifyGeometriesAsBBox 
    4445from ea_model.ceda_metadatamodel.ceda_observationcollection.ceda_observationcollection import CEDA_ObservationCollection 
    4546from ea_model.ceda_metadatamodel.ceda_observation.ceda_observation import CEDA_Observation 
    … …  
    113114    def updateCedaObject(self, ceda_object, cols_to_update): 
    114115        """ 
    115             Update and eventually commit a CEDA Object in MOLES3 db.  
     116            Update, eventually add to the session, and commit a CEDA Object in MOLES3 db.  
    116117            @param ceda_object: the CEDA object to update 
    117118            @param cols_to_update: a dictionary containing the columns to update for the given ceda_object and the desired value. 
    … …  
    121122        coll = None 
    122123        try: 
    123             coll = self._session.merge(ceda_object) 
     124            if ceda_object in self._session: 
     125                coll = self._session.merge(ceda_object) 
     126            else: 
     127                self._session.add(ceda_object) 
     128                coll = ceda_object    
    124129        except Exception as e: 
    125130            print e 
    … …  
    157162                           ge.eastBoundLongitude, ge.northBoundLatitude) 
    158163        return None 
    159      
    160      
    161      
    162     def getUnifyObservationCollectionGE(self, collection): 
     164 
     165    def getUnifyObservationCollectionGEAsBBox(self, collection): 
    163166        """ 
    164167            Returns the union of the collections.member'a  GeographicExtension(s) 
    … …  
    170173                bboxes.append(self.getGeograpicExtentGeometry(ge)) 
    171174         
    172         return unifyGeometries(bboxes, self)   
     175        return unifyGeometriesAsBBox(bboxes, self)   
     176         
    173177 
    174178    def retrieveGUIDFromInstance(self, instance): 

  • mauRepo/MolesManager/trunk/src/libs/migration/processor/dataEntity.py

    r8415 r8416  
    3838    isoDateTimeStringToTimeDate, findUpdatedDate, createDate,\ 
    3939    calculateHash, findDOIInMigrationDocument,\ 
    40     hasMOBeenProcessed, getAtomDocumentHashByMO, extractTitle, extractSummary 
     40    hasMOBeenProcessed, getAtomDocumentHashByMO, extractTitle, extractSummary,\ 
     41    createEX_GeographicBoundingBox 
    4142from libs.migration.processor.deployment import DeploymentProcessor 
    4243from logging import StreamHandler 
    … …  
    6667        #    raise MigrationObjectException("DataEntityProcessor cannot process an None item") 
    6768        self._dataEntityMigration = dataEntityMigration         
    68         self._dataEntityHasSameHash = hasMOSameHash(self._dataEntityMigration)        
     69        self._dataEntityHasSameHash = hasMOSameHash(self._dataEntityMigration)     
     70        self._dataEntityHasBeenProcessed = hasMOBeenProcessed(self._dataEntityMigration)    
    6971        self.epbRepo = epbRepo 
    7072 
    71     def _checkGeographicExtent(self, ceda_observationCollection): 
    72         union = self.moles3epb.getUnifyObservationCollectionGE(ceda_observationCollection) 
     73    def _assignGeographicExtent(self, ceda_observationCollection): 
     74        bbox = self.epbRepo.moles3EPB.getUnifyObservationCollectionGEAsBBox(ceda_observationCollection) 
     75        if bbox: 
     76            upperCornerData, lowerCornerData = bbox[4:len(bbox)-1].split(',') 
     77            east, north = upperCornerData.split() 
     78            west, south = lowerCornerData.split() 
     79            geographicExtent = createEX_GeographicBoundingBox(float(east), float(north), \ 
     80                                                              float(west), float(south)) 
     81            if self._dataEntityHasBeenProcessed: 
     82                DataEntityProcessor.log.warn('The _assignGeographicExtent update is skipped because not implemented') 
     83                return 
     84             
     85            self.epbRepo.moles3EPB.updateCedaObject(ceda_observationCollection, {'geographicExtent': geographicExtent})                         
     86        else: 
     87            print "No Geographic Extent" 
     88        return           
     89         
    7390 
    7491    def _assignDescription(self, ceda_observationCollection): 
    75         if self._dataEntityHasSameHash: 
    76             return 
    77  
    7892        description = extractSummary(self._dataEntityMigration) 
    7993             
    … …  
    8296     
    8397    def _processTitle(self, ceda_observationCollection): 
    84         if self._dataEntityHasSameHash: 
    85             return 
    86                  
    8798        ititle = extractTitle(self._dataEntityMigration) 
    8899        if ceda_observationCollection.identifier: 
    … …  
    97108        i_citation = createCI_Citation(title = CEDA_TITLE) 
    98109        newIdentifier = createMD_Identifier(code = ititle, authority=i_citation) 
    99         ceda_observationCollection.identifier.append(newIdentifier)      
     110         
     111        if self._dataEntityHasBeenProcessed: 
     112            DataEntityProcessor.log.warn('The _assignGeographicExtent update is skipped because not implemented') 
     113            return 
     114             
     115        self.epbRepo.moles3EPB.updateCedaObject(ceda_observationCollection, {'identifier': newIdentifier}) 
    100116     
    101117    def _processCitation(self, ceda_observationCollection): 
    … …  
    104120            DataEntityProcessor.log.info("The migration object "+ migrationObjectDescription(self._dataEntityMigration) \ 
    105121                                         + " has not associated cedacat:citation") 
    106         else: 
    107             ci_dates = [] 
    108             doc_date = findPublishedDate(self._dataEntityMigration)             
    109             if doc_date: 
    110                 i_date = createDate(isoDateTimeStringToTimeDate(doc_date))            
    111                 ci_dates.append(createCI_Date(getCLValue(CI_DateTypeCode.cl_publication), date = i_date)) 
    112  
    113             doc_date = findUpdatedDate(self._dataEntityMigration)             
    114             if doc_date: 
    115                 i_date = createDate(isoDateTimeStringToTimeDate(doc_date))                 
    116                 ci_dates.append(createCI_Date(getCLValue(CI_DateTypeCode.cl_revision), date = i_date)) 
    117                  
    118             i_citation = createCI_Citation(title = 'ceda_moles2_citation', date=ci_dates) 
    119             newIdentifier = createMD_Identifier(code = contentDict['citation'], authority=i_citation) 
    120             ceda_observationCollection.identifier.append(newIdentifier) 
     122            return 
     123 
     124        ci_dates = [] 
     125        doc_date = findPublishedDate(self._dataEntityMigration)             
     126        if doc_date: 
     127            i_date = createDate(isoDateTimeStringToTimeDate(doc_date))            
     128            ci_dates.append(createCI_Date(getCLValue(CI_DateTypeCode.cl_publication), date = i_date)) 
     129 
     130        doc_date = findUpdatedDate(self._dataEntityMigration)             
     131        if doc_date: 
     132            i_date = createDate(isoDateTimeStringToTimeDate(doc_date))                 
     133            ci_dates.append(createCI_Date(getCLValue(CI_DateTypeCode.cl_revision), date = i_date)) 
     134             
     135        i_citation = createCI_Citation(title = 'ceda_moles2_citation', date=ci_dates) 
     136        newIdentifier = createMD_Identifier(code = contentDict['citation'], authority=i_citation) 
     137 
     138        if self._dataEntityHasBeenProcessed: 
     139            DataEntityProcessor.log.warn('The _assignGeographicExtent update is skipped because not implemented') 
     140            return 
     141         
     142        ceda_observationCollection = self.epbRepo.moles3EPB.updateCedaObject(ceda_observationCollection, {'identifier': newIdentifier}) 
     143         
    121144 
    122145    def _execute(self, ceda_observationCollection):  
    … …  
    127150        """ 
    128151         
    129         self._processTitle(ceda_observationCollection) 
    130         self._assignDescription(ceda_observationCollection)         
    131          
    132152        if not self._dataEntityHasSameHash: 
    133             self._processCitation(ceda_observationCollection)             
    134             #self._processResult(ceda_observationCollection) 
     153            self._processTitle(ceda_observationCollection) 
     154            self._assignDescription(ceda_observationCollection) 
     155            self._processCitation(ceda_observationCollection) 
    135156         
    136157        #Is a first time process? 
    … …  
    224245                                       
    225246            except Exception as ex: 
    226                 exs.append(ex) 
    227                  
    228         self._checkGeographicExtent(obsColl) 
     247                exs.append(ex)                 
     248        self._assignGeographicExtent(obsColl) 
    229249           
    230250        return exs 

  • mauRepo/MolesManager/trunk/src/libs/migration/processor/deployment.py

    r8409 r8416  
    439439            if ge: 
    440440                geographicExtent = createEX_GeographicBoundingBox(ge['east'], ge['north'], ge['west'], ge['south']) 
    441                 if not self._deploymentHasBeenProcessed: 
    442                     observation.geographicExtent.append(geographicExtent) 
     441                if self._deploymentHasBeenProcessed: 
     442                    DeploymentProcessor.log.warn('The _assignGeographicExtent update is skipped because not implemented') 
     443                observation.geographicExtent.append(geographicExtent) 
     444            else: 
     445                print "No Geographic Extent" 
    443446            return           
    444447        #Still have to update observation.geographicExtent 

  • mauRepo/MolesManager/trunk/src/libs/postgisutil.py

    r8392 r8416  
    5656    return _processGeometries(bboxes, epb, 'ST_Union') 
    5757 
     58def unifyGeometriesAsBBox(bboxes, epb): 
     59    union = _processGeometries(bboxes, epb, 'ST_Union') 
     60    return getBox2D(union, epb) 
     61 
    5862def intersectGeometries(bboxes, epb): 
    5963    return _processGeometries(bboxes, epb, 'ST_Intersection') 
     64 
     65def getBox2D(geometry, epb): 
     66    cmdString = 'SELECT ST_Box2D(st_setSRID(\'%s\', 4326));' % (geometry) 
     67    bbox = normalizeUnicode(epb.executeNative(cmdString).first()[0]) 
     68    return bbox 
    6069         
    6170def _processGeometries(bboxes, epb, function): 
    … …  
    8695 
    8796def normalizeUnicode(text): 
    88     return unicodedata.normalize('NFKD', text).encode('ascii','ignore') 
     97    if isinstance(text, unicode): 
     98        return unicodedata.normalize('NFKD', text).encode('ascii','ignore') 
     99    return text 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.