source: TI02-CSML/trunk/csml/parser.py @ 3097

Subversion URL: http://proj.badc.rl.ac.uk/svn/ndg/TI02-CSML/trunk/csml/parser.py@3221
Revision 3097, 56.4 KB checked in by domlowe, 12 years ago (diff)

replaced cgi.escape with Bryan/Alan?'s escaping class that handles double escaping problem

Line 
1#import cElementTree as ET
2#import elementtree.ElementTree as etree
3try: #python 2.5
4    from xml.etree import ElementTree as etree
5except ImportError:
6    try:
7        # if you've installed it yourself it comes this way
8        import ElementTree as etree
9    except ImportError:
10        # if you've egged it this is the way it comes
11        from elementtree import ElementTree as etree
12
13try: #python 2.5
14    from xml.etree import cElementTree as ET
15except ImportError:
16    try:
17        # if you've installed it yourself it comes this way
18        import cElementTree as ET
19    except ImportError:
20        # if you've egged it this is the way it comes
21        from celementtree import cElementTree as ET
22
23import sys, traceback
24import csml
25import re
26'''CSML v2 Parser ''' 
27
28etree._namespace_map.update({'http://www.opengis.net/om': 'om', 'http://www.opengis.net/swe': 'swe',  'http://www.opengis.net/gml': 'gml','http://ndg.nerc.ac.uk/csml' : 'csml', 'http://www.w3.org/1999/xlink':'xlink'})
29
30nsCSML = 'http://ndg.nerc.ac.uk/csml'
31nsGML = 'http://www.opengis.net/gml'
32nsOM = 'http://www.opengis.net/om'
33nsXLINK = 'http://www.w3.org/1999/xlink'
34nsXML = 'http://ndg.nerc.ac.uk/csml'
35nsMOLES='http://ndg.nerc.ac.uk/moles'
36nsSWE='http://www.opengis.net/swe'
37
38MAINATTRIBUTELIST=[]
39
40def CSML(tag):
41    return "{"+nsCSML+"}"+tag
42
43def GML(tag):
44    return "{"+nsGML+"}"+tag
45
46def SWE(tag):
47    return "{"+nsSWE+"}"+tag
48
49def XLINK(tag):
50    return "{"+nsXLINK+"}"+tag
51
52def MOLES(tag):
53    return "{"+nsMOLES+"}"+tag
54
55def addchildren(obj, dict):
56    ''' merges (adds) dictionary to existing self.CHILDREN dictionary '''
57    dict1 = dict
58    if 'CHILDREN' in obj.__dict__:
59      dict2=obj.CHILDREN
60    else:
61      dict2={}
62    dict3={}
63    for item in dict1:
64        dict3[item] =dict1[item]
65    for item in dict2:
66        dict3[item] =dict2[item]
67    obj.CHILDREN=dict3
68   
69
70def addatts(obj, atts):
71  ''' merges self.ATTRIBUTES  of inherited classes'''
72  if 'ATTRIBUTES' in obj.__dict__:
73    for att in atts:
74        obj.ATTRIBUTES.append(att)
75        if att not in MAINATTRIBUTELIST:
76            MAINATTRIBUTELIST.append(att)
77  else:
78    obj.ATTRIBUTES=atts
79 
80
81def addelems(obj, elems):
82  ''' merges self.elems of inherited classes'''
83  if 'ELEMORDER' in obj.__dict__:
84    for elem in elems:
85        obj.ELEMORDER.append(elem)
86  else:
87    obj.ELEMORDER=elems
88
89
90#Some variable definitions: these things are often repeated so store in variables.
91FILEFORMATS=[CSML('NetCDFExtract'),CSML('NASAAmesExtract'), CSML('GRIBExtract'),CSML('CDMLExtract'), CSML('RawFileExtract'), CSML('ImageFileExtract'), CSML('AggregatedArray')]
92
93class subAI:
94    ''' This is Alan Iwi's substitute and replace orphan <> and & code '''
95    def __init__(self):
96        self.r1=re.compile('<([^>]*(<|$))')
97        self.r2=re.compile('((^|>)[^<]*)>')
98        self.r3=re.compile('&(?!(amp|lt|gt);)')
99    def sub(self,s):
100        old=''
101        s=self.r3.sub(r'&amp;',s)
102        s=s.replace(';amp',';')
103        while s != old:
104            old=s
105            s=self.r1.sub(r'&lt;\1',s)
106            s=self.r2.sub(r'\1&gt;',s)
107        return s
108
109
110class csElement(object):
111    ''' main csElement class - all other elements inherit from this baseclass 
112    all the from/to XML conversion is done by this class'''
113   
114    def __init__(self, **kwargs):
115        for kw in kwargs:
116            self.__setattr__(kw, kwargs[kw])
117        if not hasattr(self, 'ATTRIBUTES'):
118            self.__dict__['ATTRIBUTES']=[]
119        if not hasattr(self, 'ELEMORDER'):
120            self.__dict__['ELEMORDER']=[]       
121        if not hasattr(self, 'CHILDREN'):
122            self.__dict__['CHILDREN']={}
123        self.cleanup=subAI()
124    #The __setattr__ and __getattribute__ special methods have been overridden.
125    #This is so that attributes can be called by their fully qualified name internally
126    #while being referenced by their short name externally.
127    # so 'id' and {'http://www.opengis.net/gml'}id always have the same value
128    #you can set either of them at any time and the other will be kept in sync.
129       
130    def __setattr__(self, name, value):
131        if CSML(name) in self.__dict__:
132            object.__setattr__(self, CSML(name), value)
133            object.__setattr__(self, name, value)
134        elif GML(name) in self.__dict__:       
135            object.__setattr__(self, GML(name), value)
136            object.__setattr__(self, name, value)
137        elif XLINK(name) in self.__dict__:       
138            object.__setattr__(self, XLINK(name), value)
139            object.__setattr__(self, name, value) 
140        else:
141            if 'ATTRIBUTES' in self.__dict__:
142                if CSML(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
143                    object.__setattr__(self, CSML(name), value)
144                    object.__setattr__(self, name, value)
145                elif GML(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
146                    object.__setattr__(self, GML(name), value)
147                    object.__setattr__(self, name, value)
148                elif XLINK(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
149                    object.__setattr__(self, XLINK(name), value)
150                    object.__setattr__(self, name, value)
151                elif name in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
152                    object.__setattr__(self, name, value)
153                    try:
154                        name=name.split('}')[1]
155                    except IndexError:
156                        pass
157                    object.__setattr__(self, name, value)
158                else:
159                    object.__setattr__(self, name, value)
160            else:
161                    object.__setattr__(self, name, value)
162   
163    def __getattribute__(self, name):
164        if name in MAINATTRIBUTELIST:
165            if CSML(name) in object.__dict__:
166                return object.__getattribute__(self,CSML(name))
167            elif GML(name) in object.__dict__:
168                return object.__getattribute__(self,GML(name))
169            elif XLINK(name) in object.__dict__:
170                return object.__getattribute__(self,XLINK(name))
171            else:
172                return object.__getattribute__(self,name) 
173        else:
174            return object.__getattribute__(self,name)
175   
176    def __removeURI(self, qname):
177        try:
178            attname = qname.split('}')[1]
179        except IndexError:
180            attname = qname
181        return attname
182       
183    def _getSubstitutionType(self,tag):
184        return tag.split('}')[1]
185       
186   
187    def _getReverseSubsType(self, typename):
188        return typename
189   
190    def addChildElem(self, childname, childobj):
191        #sometimes you want to add a child element but don't know if there is one already. In which case you want to create a list of child objects.
192        if childname in self.__dict__:
193            currentattribute=getattr(self,childname)
194            if type(getattr(self,childname)) is list:
195                currentattribute.append(childobj)
196            else:
197                newlist=[currentattribute]
198                newlist.append(childobj)
199                setattr(self,childname, newlist)
200        else:
201            setattr(self,childname, childobj)
202
203    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
204        #process self and convert to XML     
205        if 'CONTENT' in self.__dict__:
206            if self.CONTENT is not None: csmlfrag.text=self.cleanup.sub(self.CONTENT)
207        if 'ATTRIBUTES' in self.__dict__:
208            for item in self.__dict__:
209                if item in self.ATTRIBUTES:                   
210                    csmlfrag.set(item, self.cleanup.sub(str((self.__dict__[item]))))
211    # self.CHILDREN (recursive - calls the toXML method of children
212        for child in self.ELEMORDER:
213            if not self.__dict__.has_key(child):
214                continue
215            appendLater=False
216            parserobjects=[]
217            if type(self.__dict__[child]) is list:
218                for a in self.__dict__[child]:
219                    parserobjects.append(a)
220            else:
221                parserobjects.append(self.__dict__[child])
222            parentfrag=None
223            if len(self.CHILDREN[child])>=3:
224                    ename2=self.CHILDREN[child][2]
225                    parentfrag=ET.Element(ename2)
226            for po in parserobjects:
227                if type(self.CHILDREN[child][0]) is not list:
228                    ename=self.CHILDREN[child][0]
229                else:
230                    ename = self._getReverseSubsType(type(po).__name__)
231                if len(self.CHILDREN[child])==3:
232                    frag=ET.Element(ename)
233                    po.toXML(frag)
234                    parentfrag.append(frag)
235                    appendLater=True
236                elif len(self.CHILDREN[child])>=4:
237                    if self.CHILDREN[child][3]==1:
238                        frag=ET.Element(ename)
239                        po.toXML(frag)
240                        parentfrag.append(frag)
241                        csmlfrag.append(parentfrag)
242                        parentfrag=ET.Element(parentfrag.tag)
243                        appendLater=False
244                else:
245                    frag=ET.Element(ename)
246                    try:
247                        po.toXML(frag)
248                    except:
249                        print 'PARSING ERROR - could not convert %s to XML'%frag
250                        print dir(ename)
251                        raise
252                    csmlfrag.append(frag)
253                    appendLater=True
254
255                if appendLater==True and parentfrag != None:             
256                    csmlfrag.append(parentfrag)   
257
258        return csmlfrag
259       
260    def fromXML(self,csmlfrag):
261        self.elem=csmlfrag
262        # deal with attributes, e.g. gml id's
263        if csmlfrag.text is not None:
264                self.CONTENT = csmlfrag.text
265        for item in csmlfrag.items():
266            if item[0] in self.ATTRIBUTES:
267                setattr(self, item[0], item[1])
268        #self.CHILDREN (recursive - calls the fromXML method of children
269        for frag in csmlfrag[:]:
270            #for each child element
271            #iterate through expected CHILDREN to find match
272            for child in self.CHILDREN:
273                if len(self.CHILDREN[child])>=3:
274                    ename = self.CHILDREN[child][2]
275                    ename2 = self.CHILDREN[child][0]
276                else:
277                    ename = self.CHILDREN[child][0] 
278                    ename2=None
279                #if there are options, then find the name that matches the frag
280                if ename2 is not None:
281                    if frag[:] != []:
282                        for subfrag in frag[:]:
283                            etype=None
284                            if type(ename2) is list:
285                                if subfrag.tag in ename2:
286                                    etype=self._getSubstitutionType(subfrag.tag)
287                            if subfrag.tag==ename2:
288                                etype=self.CHILDREN[child][1]
289                            if etype:
290                                childobj=eval(etype)()
291                                if len(self.CHILDREN[child])>=3:
292                                    if frag[:] != []:
293                                        childobj.fromXML(subfrag)
294                                else:
295                                    childobj.fromXML(frag)
296                                #set this object to be an attribute of the 'parent' (self) object
297                                if child in self.__dict__:
298                                    if type(self.__dict__[child]) is not list:
299                                        tmp=self.__dict__[child]
300                                        setattr(self, child, [tmp]) #convert to list
301                                    self.__dict__[child].append(childobj)
302                                else:
303                                    setattr(self, child, childobj)
304                else:
305                    etype=None
306                    if type(ename) is list:
307                        if frag.tag in ename:
308                            etype=self._getSubstitutionType(frag.tag)
309                    elif frag.tag==ename:
310                        etype=self.CHILDREN[child][1]
311                    if etype:
312                        childobj=eval(etype)()
313                        if len(self.CHILDREN[child])>=3:
314                            if frag[:] != []:
315                                childobj.fromXML(frag[0])
316                        else:
317                            childobj.fromXML(frag)
318                           
319                        #set this object to be an attribute of the 'parent' (self) object
320                        if child in self.__dict__:
321                            if type(self.__dict__[child]) is not list:
322                                tmp=self.__dict__[child]
323                                setattr(self, child, [tmp]) #convert to list
324                            self.__dict__[child].append(childobj)
325                        else:
326                            setattr(self, child, childobj)
327
328               
329   
330class AbstractGML(csElement):
331    def __init__(self, **kwargs):
332        a=[GML('id')]
333        addatts(self,a)
334        elems=['metaDataProperty', 'description','name']
335        addelems(self,elems)
336        children={elems[0]:[GML('metaDataProperty'),'csString'],elems[1]:[GML('description'),'csString'],elems[2]:[GML('name'),'csString']}
337        addchildren(self,children)
338        csElement.__init__(self,**kwargs)
339       
340class AssociationAttributeGroup(csElement):
341    def __init__(self, **kwargs):
342        a =[XLINK('href'),XLINK('role'), XLINK('arcrole'),XLINK('title'), XLINK('show'), XLINK('actuate')] 
343        addatts(self,a)
344        csElement.__init__(self,**kwargs)
345       
346class csString(AssociationAttributeGroup, csElement):
347    def __init__(self, text=None,**kwargs):
348        #Needed so it can use xlink
349        addelems(self,[])
350        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
351        if text != None:
352            if type(text) is not str:
353                text=str(text)
354            self.CONTENT=text
355        children={}
356        addchildren(self,children)
357        csElement.__init__(self,**kwargs)
358       
359class SRSReferenceGroup(csElement):
360    def __init__(self, **kwargs):
361        a =['srsName','srsDimension'] 
362        addatts(self,a)
363        csElement.__init__(self,**kwargs)
364               
365class SRSInformationGroup(csElement):
366    def __init__(self, **kwargs):
367        a =['uomLabels','axisLabels']
368        addatts(self,a)
369        csElement.__init__(self,**kwargs)
370       
371class ArrayDescriptor(csElement):
372    def __init__(self,**kwargs):
373        a=['id']
374        addatts(self,a)
375        elems=['arraySize', 'uom', 'numericType','regExpTransform','numericTransform']
376        addelems(self,elems)
377        children={elems[0]:[CSML('arraySize'), 'csString'], elems[1]:[CSML('uom'),'csString'], elems[2]:[CSML('numericType'),'csString'], elems[3]:[CSML('regExpTransform'),'csString'], elems[4]:[CSML('numericTransform'),'csString']}
378        addchildren(self,children)
379        csElement.__init__(self,**kwargs)
380               
381class GridEnvelope(AbstractGML,SRSReferenceGroup, csElement):
382    def __init__(self, **kwargs):
383        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
384        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
385        elems=['low', 'high']
386        addelems(self,elems)
387        children={elems[0]:[GML('low'), 'csString'],elems[1]:[GML('high'), 'csString']}
388        addchildren(self,children)
389        csElement.__init__(self,**kwargs)
390       
391class Envelope(AbstractGML,SRSReferenceGroup, csElement):
392    def __init__(self, **kwargs):
393        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
394        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
395        elems=['lowerCorner','upperCorner']
396        addelems(self,elems)
397        children={elems[0]:[GML('lowerCorner'), 'csString'],elems[1]:[GML('upperCorner'), 'csString']}
398        addchildren(self,children)
399        csElement.__init__(self,**kwargs)
400       
401class EnvelopeWithTimePeriod(Envelope):
402    def __init__(self, **kwargs):
403        Envelope.__init__(self,**kwargs)
404        elems=['beginPosition', 'endPosition']
405        addelems(self,elems)
406        children={elems[0]:[GML('beginPosition'), 'csString'], elems[1]:[GML('endPosition'), 'csString']}
407        addchildren(self,children)
408        csElement.__init__(self,**kwargs)
409
410class AbstractFeature(AbstractGML,csElement):
411    def __init__(self, **kwargs):
412        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
413        elems=['boundedBy']
414        addelems(self,elems)
415        #this pattern works but can only accept EnvelopeWithTimePeriod for the boundedBy,
416        #which is probably ok   
417        children={elems[0]:[GML('EnvelopeWithTimePeriod'), 'EnvelopeWithTimePeriod', GML('boundedBy')]}
418        addchildren(self,children)
419        csElement.__init__(self,**kwargs)
420       
421class AbstractFeatureCollection(AbstractFeature,csElement):
422    def __init__(self, **kwargs):
423        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
424        csElement.__init__(self,**kwargs)
425       
426class DomainSet(AbstractGML,AssociationAttributeGroup,csElement):
427    def __init__(self, **kwargs):
428        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
429        addchildren(self,{})
430        csElement.__init__(self,**kwargs)
431       
432class AggregatedArray(ArrayDescriptor,csElement):
433    def __init__(self, **kwargs):
434        ArrayDescriptor.__init__(self,**kwargs)
435        elems=['aggType', 'aggIndex', 'components']
436        addelems(self,elems)
437        children={elems[0]:[CSML('aggType'),'csString'], elems[1]:[CSML('aggIndex'),'csString'],elems[2]:[FILEFORMATS, 'ArrayDescriptor',CSML('component')]}
438        addchildren(self,children)
439        csElement.__init__(self,**kwargs)
440       
441
442class MeasureOrNullList(AbstractGML,AssociationAttributeGroup, csElement):
443    def __init__(self, **kwargs):
444        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
445        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
446        elems=['insertedExtract']
447        addelems(self,elems)
448        #note insertedExtract is used in resolving xlinks and shouldn't be written to directly (except by the code which handles the xlink resolutions)
449        children={elems[0]:[FILEFORMATS,'FileExtract',CSML('insertedExtract')]}
450        addchildren(self,children)
451        a =['uom'] 
452        addatts(self,a)
453        csElement.__init__(self,**kwargs)
454       
455    def toXML(self,csmlfrag,**kwargs):
456        temp=None
457        if hasattr(self, 'insertedExtract'):         
458            temp=self.insertedExtract
459            del self.insertedExtract  #don't want to expose this in XML       
460        csmlfrag=csElement.toXML(self,csmlfrag, **kwargs)
461        if temp is not None:
462            self.insertedExtract=temp
463        return csmlfrag
464       
465       
466class CompositeValue(AbstractGML,csElement):
467    def __init__(self, **kwargs):
468        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
469        elems=['measures']
470        addelems(self,elems)
471        children={elems[0]:[GML('measure'),'csString',GML('valueComponents')]}
472        addchildren(self,children)
473        csElement.__init__(self,**kwargs)
474       
475class DataBlock(AbstractGML,csElement):
476    #THIS IS INCOMPLETE
477    def __init__(self, **kwargs):
478        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
479        elems=['doubleOrNullTupleList','rangeParameters']
480        addelems(self,elems)
481        children={elems[0]:[GML('doubleOrNullTupleList'),'csString'],elems[1]:[GML('CompositeValue'), 'CompositeValue', GML('rangeParameters')]}
482        addchildren(self,children)
483        csElement.__init__(self,**kwargs)
484
485class ValueArray(AbstractGML, csElement):
486    def __init__(self, **kwargs):
487        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
488        elems=['valueComponent']
489        addelems(self,elems)
490        children=children={elems[0]:[GML('QuantityList'), 'MeasureOrNullList', GML('valueComponent')]}
491        addchildren(self,children)
492        csElement.__init__(self,**kwargs)
493       
494    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
495        csmlfrag=AbstractGML.toXML(self, csmlfrag,**kwargs)
496        #promote XLinks up from QuantityList
497        #this all done at the elementtree level
498       
499        for frag in csmlfrag:
500            if frag.tag ==GML('valueComponent'):
501                try:       
502                    frag.set(XLINK('href'),self.valueComponent.href)                               
503                    for subfrag in frag:   
504                        del subfrag.attrib[XLINK('href')]                                                             
505                except:
506                    pass
507                try:       
508                    frag.set(XLINK('show'),self.valueComponent.show)                               
509                    for subfrag in frag:   
510                        del subfrag.attrib[XLINK('show')]                                                             
511                except:
512                    pass
513                try:       
514                    frag.set(XLINK('role'),self.valueComponent.role)                               
515                    for subfrag in frag:   
516                        del subfrag.attrib[XLINK('role')]                                                             
517                except:
518                    pass
519                try:       
520                    frag.set(XLINK('arcrole'),self.valueComponent.arcrole)                               
521                    for subfrag in frag:   
522                        del subfrag.attrib[XLINK('arcrole')]                                                             
523                except:
524                    pass
525        return csmlfrag
526               
527    def fromXML(self, csmlfrag):   
528        #promote xlinks up a level to the  property element
529        for frag in csmlfrag:
530            if frag.tag == GML('valueComponent'):             
531                for att in ['href', 'show', 'role', 'arcrole']:
532                    try: 
533                        for subfrag in frag[:]:
534                            subfrag.set(XLINK(att),frag.attrib[XLINK(att)])     
535                    except:
536                        pass
537        csElement.fromXML(self, csmlfrag)       
538
539class RangeSet(AbstractGML,AssociationAttributeGroup,csElement):
540    def __init__(self, **kwargs):
541        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
542        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
543        elems=['quantityList', 'dataBlock', 'arrayDescriptor', 'valueArray']
544        addelems(self,elems)
545        children={elems[0]:[GML('QuantityList'), 'MeasureOrNullList'],        elems[1]:[GML('DataBlock'),'DataBlock'],elems[2]:[FILEFORMATS, 'ArrayDescriptor'],  elems[3]:[CSML('AggregatedArray'), 'AggregatedArray'],
546        elems[3]:[GML('ValueArray'),'ValueArray']}
547        addchildren(self,children)
548        csElement.__init__(self,**kwargs)
549       
550class MultiPoint(AbstractGML, SRSReferenceGroup,csElement):
551    def __init__(self, **kwargs):
552        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
553        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
554        elems=['pointMember','pointMembers']
555        addelems(self,elems)
556        children={elems[0]:[GML('pointMember'), 'csString'],elems[1]:[GML('pointMembers'), 'csString']}
557        addchildren(self,children)
558        csElement.__init__(self,**kwargs)
559       
560class Point(AbstractGML,SRSReferenceGroup,csElement):
561    def __init__(self, **kwargs):
562        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
563        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
564        elems=['pos','coordinates']
565        addelems(self,elems)
566        children={elems[0]:[GML('pos'), 'csString'],elems[1]:[GML('coordinates'), 'csString']}
567        addchildren(self,children)
568        csElement.__init__(self,**kwargs)
569       
570class PointDomain(DomainSet, MultiPoint,csElement):
571    def __init__(self, **kwargs):
572        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
573        MultiPoint.__init__(self,**kwargs)
574        children={}
575        addchildren(self,children)
576        csElement.__init__(self,**kwargs)
577       
578class ProfileDomain(DomainSet, MultiPoint,csElement):
579    def __init__(self, **kwargs):
580        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
581        MultiPoint.__init__(self,**kwargs)
582        children={}
583        addchildren(self,children)
584        csElement.__init__(self,**kwargs)
585
586
587class AbstractCoverage(AbstractFeature, csElement):
588    def __init__(self, **kwargs):
589        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
590        csElement.__init__(self,**kwargs)
591       
592class AbstractDiscreteCoverage(AbstractCoverage, csElement):
593    def __init__(self, **kwargs):
594        AbstractCoverage.__init__(self,**kwargs)
595        addchildren(self,{})
596        csElement.__init__(self,**kwargs)
597       
598class Definition(AbstractGML):
599    def __init__(self, **kwargs):
600        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
601        addchildren(self,{})
602        csElement.__init__(self,**kwargs)
603       
604class Phenomenon(Definition,AssociationAttributeGroup):
605    def __init__(self, **kwargs):
606        Definition.__init__(self,**kwargs)
607        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
608        children = {'':[CSML(''), '']}   
609        addchildren(self,children)
610        csElement.__init__(self,**kwargs)
611               
612class SpatialOrTemporalPositionList(AssociationAttributeGroup, AbstractGML,  csElement):
613    def __init__(self, **kwargs):
614        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
615        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
616        elems=['coordinateList', 'timePositionList','insertedExtract']
617        addelems(self,elems)
618        children={elems[0]:[CSML('coordinateList'),'csString'], elems[1]:[CSML('timePositionList'),'TimePositionList'],elems[2]:[FILEFORMATS,'FileExtract',CSML('insertedExtract')]}
619        addchildren(self,children)
620        csElement.__init__(self,**kwargs)
621   
622    def toXML(self,csmlfrag,**kwargs):
623        temp=None
624        if hasattr(self, 'insertedExtract'):
625            temp=self.insertedExtract
626            del self.insertedExtract  #don't want to expose this in XML       
627        csmlfrag=csElement.toXML(self,csmlfrag, **kwargs)
628        #This is mandatory even if empty when using xlink               
629        if not hasattr(self, 'timePositionList'):
630            if not hasattr(self, 'coordinateList'):
631                 if csmlfrag.get(XLINK('arcrole')) is not None:
632                    if csmlfrag.get(XLINK('arcrole')).split('#')[1] == 'timePositionList':
633                        ET.SubElement(csmlfrag, CSML('timePositionList'))
634                    elif csmlfrag.get(XLINK('arcrole')).split('#')[1] =='coordinateList':
635                        ET.SubElement(csmlfrag, CSML('coordinateList'))                       
636        if temp !=None:
637            self.insertedExtract=temp
638        return csmlfrag
639
640class GridOrdinateDescription(AbstractGML,csElement):
641    def __init__(self, **kwargs):
642        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
643        elems=['coordAxisLabel', 'coordAxisValues', 'gridAxesSpanned', 'sequenceRule']
644        addelems(self,elems)
645        children={elems[0]:[CSML('coordAxisLabel'), 'csString'], elems[1]:[CSML('SpatialOrTemporalPositionList'),'SpatialOrTemporalPositionList',CSML('coordAxisValues')], elems[2]:[CSML('gridAxesSpanned'), 'csString'], elems[3]:[CSML('sequenceRule'),'SequenceRule']}
646        addchildren(self,children)
647        csElement.__init__(self,**kwargs)
648    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
649        csmlfrag=AbstractGML.toXML(self, csmlfrag,**kwargs)
650        #promote XLinks up from SpatialOrTemporalPositionList       
651        #this all done at the elementtree level
652       
653        for frag in csmlfrag:
654            if frag.tag ==CSML('coordAxisValues'):
655                try:       
656                    frag.set(XLINK('href'),self.coordAxisValues.href)                               
657                    for subfrag in frag:   
658                        del subfrag.attrib[XLINK('href')]                                                             
659                except:
660                    pass
661                try:       
662                    frag.set(XLINK('show'),self.coordAxisValues.show)                               
663                    for subfrag in frag:   
664                        del subfrag.attrib[XLINK('show')]                                                             
665                except:
666                    pass
667                try:       
668                    frag.set(XLINK('role'),self.coordAxisValues.role)                               
669                    for subfrag in frag:   
670                        del subfrag.attrib[XLINK('role')]                                                             
671                except:
672                    pass
673                try:       
674                    frag.set(XLINK('arcrole'),self.coordAxisValues.arcrole)                               
675                    for subfrag in frag:   
676                        del subfrag.attrib[XLINK('arcrole')]                                                             
677                except:
678                    pass
679             
680
681        return csmlfrag
682   
683    def fromXML(self, csmlfrag):
684        #promote xlinks up a level to the coordAxisValues property element
685        for frag in csmlfrag:
686            if frag.tag == CSML('coordAxisValues'):             
687                for att in ['href', 'show', 'role', 'arcrole']:
688                    try: 
689                        for subfrag in frag[:]:
690                            subfrag.set(XLINK(att),frag.attrib[XLINK(att)])     
691                    except:
692                        pass
693               
694        csElement.fromXML(self, csmlfrag)
695
696           
697       
698class SequenceRule(csElement):
699    def __init__(self, **kwargs):
700        a=['axisOrder']
701        addatts(self,a)
702        children={}
703        addchildren(self,children)
704        csElement.__init__(self,**kwargs)
705       
706class GridPointDescription(AbstractGML,csElement):
707    def __init__(self, **kwargs):
708        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
709        elems=['posList', 'sequenceRule']
710        addelems(self,elems)
711        children={elems[0]:[CSML('posList'),'csString'],elems[1]:[CSML('sequenceRule'),'SequenceRule']}
712        addchildren(self,children)
713        csElement.__init__(self,**kwargs)
714
715class TimePositionList(AbstractGML,csString,csElement):
716    def __init__(self, **kwargs):
717        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
718        csString.__init__(self, **kwargs)
719        elems=[]
720        addelems(self,elems)
721        a=['frame', 'calendarEraName','indeterminatePosition']
722        addatts(self,a)
723        addchildren(self,{})
724        csElement.__init__(self,**kwargs)
725
726class GridCoordinatesTable(AbstractGML,csElement):
727    def __init__(self,**kwargs):
728        '''the additional value '1' in the children dictionary is used to signify that the elements must be nested as:
729        <gml:ordinate>
730            <gml:GridOrdinateDescription>
731        </gml:ordinate>
732        <gml:ordinate>
733            <gml:GridOrdinateDescription>
734        </gml:ordinate>
735       
736        not as:
737        <gml:ordinate>
738            <gml:GridOrdinateDescription>
739            <gml:GridOrdinateDescription>
740        </gml:ordinate> '''
741        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
742        elems=['gridOrdinates' , 'gridPoints']
743        addelems(self,elems)
744        children={elems[0]:[CSML('GridOrdinateDescription'), 'GridOrdinateDescription',CSML('gridOrdinate'),1], elems[1]:[CSML('GridPointDescription'),'GridPointDescription',CSML('gridPoints')]}
745        addchildren(self,children)
746        csElement.__init__(self,**kwargs)
747       
748class Grid(AbstractGML, AssociationAttributeGroup, SRSInformationGroup, SRSReferenceGroup, csElement):
749    def __init__(self, **kwargs):
750        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
751        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
752        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
753        SRSInformationGroup.__init__(self,**kwargs)
754        a=['dimension']
755        addatts(self,a)
756        elems=['limits', 'aLabels','axisName']
757        addelems(self, elems)
758        children = {elems[1]:[CSML('axisLabels'),'csString'],elems[2]:[CSML('axisName'),'csString'], elems[0]:[GML('GridEnvelope'),'GridEnvelope',CSML('limits')]}
759        addchildren(self,children)
760        csElement.__init__(self,**kwargs)
761           
762class ReferenceableGrid(Grid, csElement):
763    def __init__(self, **kwargs):
764        Grid.__init__(self,**kwargs)
765        elems=['coordTransformTable']
766        addelems(self,elems)
767        children={elems[0]:[CSML('GridCoordinatesTable'), 'GridCoordinatesTable', CSML('coordTransformTable')]}
768        addchildren(self,children)
769        csElement.__init__(self,**kwargs)
770
771class ReferenceableGridCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
772    def __init__(self, **kwargs):
773        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
774        elems=[referenceableGridDomain]
775        addelems(self,elems)
776        children={elems[0]:[CSML('ReferenceableGrid'),'ReferenceableGrid' ,CSML('referenceableGridDomain') ]}
777        addchildren(self,children)
778        csElement.__init__(self,**kwargs)
779       
780class AlternatePointCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
781    def __init__(self, **kwargs):
782        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
783        elems=['alternatePointDomain','rangeSet','coverageFunction']
784        addelems(self,elems)
785        children={elems[0]:[GML('Point'),'Point', CSML('alternatePointDomain')], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
786        addchildren(self,children)
787        csElement.__init__(self,**kwargs)
788
789class ProfileCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
790    def __init__(self, **kwargs):
791        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
792        elems=['profileDomain', 'rangeSet' ,'coverageFunction']
793        addelems(self,elems)
794        children={elems[0]:[CSML('ProfileDomain'),'ProfileDomain' ,CSML('profileDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
795        addchildren(self,children)
796        csElement.__init__(self,**kwargs)
797       
798class PointCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
799    def __init__(self, **kwargs):
800        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
801        elems=['pointDomain','rangeSet', 'coverageFunction']
802        addelems(self,elems)
803        children={elems[0]:[CSML('PointDomain'),'PointDomain' ,CSML('pointDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
804        addchildren(self,children)
805        csElement.__init__(self,**kwargs)
806       
807class TimeSeries(AbstractGML, csElement):
808    def __init__(self, **kwargs):
809        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
810        elems=['timePositionList']
811        addelems(self,elems)
812        children={elems[0]:[CSML('timePositionList'), 'csString']}
813        addchildren(self,children)
814        csElement.__init__(self,**kwargs)
815
816class PointSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
817    def __init__(self, **kwargs):
818        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
819        elems=['pointSeriesDomain','rangeSet','coverageFunction']
820        addelems(self,elems)
821        children={elems[0]:[CSML('TimeSeries'),'TimeSeries' ,CSML('pointSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
822        addchildren(self,children)
823        csElement.__init__(self,**kwargs)
824       
825class ProfileSeriesDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
826    def __init__(self, **kwargs):
827        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
828        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
829        children={}
830        addchildren(self,children)
831        csElement.__init__(self,**kwargs)
832       
833class ProfileSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
834    def __init__(self, **kwargs):
835        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
836        elems=['profileSeriesDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
837        addelems(self,elems)
838        children={elems[0]:[CSML('ProfileSeriesDomain'),'ProfileSeriesDomain' ,CSML('profileSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
839        addchildren(self,children)
840        csElement.__init__(self,**kwargs)
841       
842class SectionDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
843    def __init__(self, **kwargs):
844        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
845        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
846        children={}
847        addchildren(self,children)
848        csElement.__init__(self,**kwargs)
849       
850class SectionCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
851    def __init__(self, **kwargs):
852        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
853        elems=['sectionDomain', 'rangeSet' , 'coverageFunction']
854        addelems(self,elems)
855        children={elems[0]:[CSML('SectionDomain'),'SectionDomain' ,CSML('sectionDomain') ],elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
856        addchildren(self,children)
857        csElement.__init__(self,**kwargs)
858       
859class TrajectoryDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
860    def __init__(self, **kwargs):
861        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
862        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
863        children={}
864        addchildren(self,children)
865        csElement.__init__(self,**kwargs)
866       
867class TrajectoryCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
868    def __init__(self, **kwargs):
869        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
870        elems=['trajectoryDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
871        addelems(self,elems)
872        children={elems[0]:[CSML('TrajectoryDomain'),'TrajectoryDomain' ,CSML('trajectoryDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
873        addchildren(self,children)
874        csElement.__init__(self,**kwargs)
875
876class ScanningRadarDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
877    def __init__(self, **kwargs):
878        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
879        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
880        children={}
881        addchildren(self,children)
882        csElement.__init__(self,**kwargs)
883       
884class ScanningRadarCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
885    def __init__(self, **kwargs):
886        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
887        elems=['scanningRadarDomain', 'rangeSet','coverageFunction']
888        addelems(self,elems)
889        children={elems[0]:[CSML('ScanningRadarDomain'),'ScanningRadarDomain' ,CSML('scanningRadarDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
890        addchildren(self,children)
891        csElement.__init__(self,**kwargs)
892
893
894class GridSeriesDomain(ReferenceableGrid, csElement):
895    def __init__(self, **kwargs):
896        #DomainSet.__init__(self,**kwargs)
897        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
898        children={}
899        addchildren(self,children)
900        csElement.__init__(self,**kwargs)
901
902class GridSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
903    def __init__(self, **kwargs):
904        elems=['gridSeriesDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
905        addelems(self,elems)
906        children={elems[0]:[CSML('GridSeriesDomain'),'GridSeriesDomain' ,CSML('gridSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
907        addchildren(self,children)
908        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
909        csElement.__init__(self,**kwargs)
910
911class AlternatePointFeature(AbstractFeature, csElement):
912    def __init__(self, **kwargs):
913        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
914        self.featureType='AlternatePointFeature'
915        elems=['location', 'time', 'value','parameter']
916        addelems(self,elems)
917        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('AlternatePointCoverage'), 'AlternatePointCoverage', CSML('value')],elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
918        addchildren(self,children)
919        csElement.__init__(self,**kwargs)
920
921class DirectPositionList(SRSReferenceGroup, csElement):
922    def __init__(self, **kwargs):
923        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
924        children=[]
925        addchildren(self,children)
926        csElement.__init__(self,**kwargs)
927       
928class PointFeature(AbstractFeature, csElement):
929    def __init__(self, **kwargs):
930        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
931        self.featureType='PointFeature'
932        elems=['location', 'time', 'value','parameter']
933        addelems(self,elems)
934        children={elems[0]:[CSML('location'), 'DirectPositionList'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('PointCoverage'), 'PointCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
935        addchildren(self,children)
936        csElement.__init__(self,**kwargs)
937
938class PointCollectionFeature(AbstractFeature, csElement):
939    def __init__(self, **kwargs):
940        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
941        self.featureType='PointCollectionFeature'
942        elems=['time', 'value', 'parameter']
943        addelems(self,elems)
944        children={elems[0]:[CSML('time'), 'csString'], elems[1]:[CSML('MultiPointCoverage'), 'MultiPointCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
945        addchildren(self,children)
946        csElement.__init__(self,**kwargs)
947
948
949class PointSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
950    def __init__(self, **kwargs):
951        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
952        self.featureType='PointSeriesFeature'
953        elems=['location','value','parameter']
954        addelems(self,elems)
955        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('PointSeriesCoverage'), 'PointSeriesCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
956        addchildren(self,children)
957        csElement.__init__(self,**kwargs)
958
959
960class GridFeature(AbstractFeature, csElement):
961    def __init__(self, **kwargs):
962        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
963        self.featureType='GridFeature'
964        elems=['time', 'value', 'parameter']
965        addelems(self,elems)
966        children={elems[0]:[CSML('time'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ReferenceableGridCoverage'), 'ReferenceableGridCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
967        addchildren(self,children)
968        csElement.__init__(self,**kwargs)
969
970class GridSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
971    def __init__(self, **kwargs):
972        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
973        self.featureType='GridSeriesFeature'
974        elems=['value','parameter']
975        addelems(self,elems)
976        children={elems[0]:[CSML('GridSeriesCoverage'), 'GridSeriesCoverage', CSML('value')],elems[1]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
977        addchildren(self,children)
978        csElement.__init__(self,**kwargs)
979
980class ProfileFeature(AbstractFeature, csElement):
981    def __init__(self, **kwargs):
982        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
983        self.featureType='ProfileFeature'
984        elems=['location', 'time','value', 'parameter']
985        addelems(self,elems)
986        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('ProfileCoverage'), 'ProfileCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
987        addchildren(self,children)
988        csElement.__init__(self,**kwargs)
989
990class ProfileSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
991    def __init__(self, **kwargs):
992        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
993        self.featureType='ProfileSeriesFeature'
994        elems=['location', 'value', 'parameter']
995        addelems(self,elems)
996        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ProfileSeriesCoverage'), 'ProfileSeriesCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
997        addchildren(self,children)
998        csElement.__init__(self,**kwargs)
999
1000class RaggedProfileSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
1001    def __init__(self, **kwargs):
1002        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1003        self.featureType='RaggedProfileSeriesFeature'
1004        elems=['location', 'profileLength', 'value', 'parameter']
1005        addelems(self,elems)
1006        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('profileLength'), 'csString'],elems[2]:[CSML('ProfileSeriesCoverage'), 'ProfileSeriesCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1007        addchildren(self,children)
1008        csElement.__init__(self,**kwargs)
1009
1010class RaggedSectionFeature(AbstractFeature, csElement):
1011    def __init__(self, **kwargs):
1012        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1013        self.featureType='RaggedSectionFeature'
1014        elems=['stationLocations', 'stationTimes', 'profileLength', 'value','parameter']
1015        addelems(self,elems)
1016        children={elems[0]:[CSML('stationLocations'), 'csString'], elems[1]:[CSML('stationTimes'), 'csString'],elems[2]:[CSML('profileLength'),'csString'],elems[3]:[CSML('SectionCoverage'), 'SectionCoverage', CSML('value')], elems[4]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1017        addchildren(self,children)
1018        csElement.__init__(self,**kwargs)
1019
1020class SectionFeature(AbstractFeature, csElement):
1021    def __init__(self, **kwargs):
1022        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1023        self.featureType='SectionFeature'
1024        elems=['stationLocations', 'stationTimes','value', 'parameter']
1025        addelems(self,elems)
1026        children={elems[0]:[CSML('stationLocations'), 'csString'], elems[1]:[CSML('stationTimes'), 'TimePositionList'],elems[2]:[CSML('SectionCoverage'), 'SectionCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1027        addchildren(self,children)
1028        csElement.__init__(self,**kwargs)
1029
1030class ScanningRadarFeature(AbstractFeature, csElement):
1031    def __init__(self, **kwargs):
1032        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1033        self.featureType='ScanningRadarFeature'
1034        elems=['elevation','value', 'parameter']
1035        addelems(self,elems)
1036        children={elems[0]:[CSML('elevation'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ScanningRadarCoverage'), 'ScanningRadarCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1037        addchildren(self,children)
1038        csElement.__init__(self,**kwargs)
1039
1040       
1041class SwathFeature(AbstractFeature, csElement):
1042    def __init__(self, **kwargs):
1043        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1044        self.featureType='SwathFeature'
1045        elems=['eqCrossLon', 'eqCrossTime', 'value', 'parameter']
1046        addelems(self,elems)
1047        children={elems[0]:[CSML('eqCrossLon'), 'csString'],elems[1]:[CSML('eqCrossTime'), 'csString'], elems[2]:[CSML('ReferenceableGridCoverage'), 'ReferenceableGridCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1048        addchildren(self,children)
1049        csElement.__init__(self,**kwargs)
1050       
1051class TrajectoryFeature(AbstractFeature, csElement):
1052    def __init__(self, **kwargs):
1053        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1054        self.featureType='TrajectoryFeature'
1055        elems=['value', 'parameter']
1056        addelems(self,elems)
1057        children={elems[0]:[CSML('TrajectoryCoverage'), 'TrajectoryCoverage', CSML('value')], elems[1]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1058        addchildren(self,children)
1059        csElement.__init__(self,**kwargs)
1060       
1061class FileList(AssociationAttributeGroup,csElement):
1062    def __init__(self,**kwargs):
1063        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)       
1064        a=['id']
1065        addatts(self,a)
1066        elems=['fileNames']
1067        addelems(self,elems)
1068        children= {elems[0]:[CSML('fileNames'), 'csString']}
1069        addchildren(self,children)
1070        csElement.__init__(self,**kwargs)
1071       
1072class FileExtract(ArrayDescriptor, csElement):
1073    def __init__(self,**kwargs):
1074        ArrayDescriptor.__init__(self,**kwargs)
1075        elems=['fileName', 'fileList', 'fileListXLINK']
1076        addelems(self,elems)
1077        children= {elems[0]:[CSML('fileName'), 'csString'],  elems[1]:[CSML('FileList'), 'FileList', CSML('fileList')],elems[2]:[CSML('fileList'), 'csString']}
1078        addchildren(self,children)
1079        csElement.__init__(self,**kwargs)
1080   
1081    def fromXML(self,csmlfrag):       
1082        ArrayDescriptor.fromXML(self,csmlfrag)         
1083        if hasattr(self, 'fileListXLINK'):
1084            if hasattr(self, 'fileList'):
1085                del self.fileListXLINK
1086   
1087   
1088class NetCDFExtract(FileExtract, csElement):
1089    def __init__(self,**kwargs):
1090        FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1091        elems=['variableName']
1092        addelems(self,elems)
1093        children={elems[0]:[CSML('variableName'), 'csString']}
1094        addchildren(self,children)
1095        csElement.__init__(self,**kwargs)
1096
1097class NASAAmesExtract(FileExtract, csElement):
1098    def __init__(self,**kwargs):
1099        FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1100        elems=['variableName', 'index']
1101        addelems(self,elems)
1102        children={elems[0]:[CSML('variableName'), 'csString'],elems[1]:[CSML('index'),'csString']}
1103        addchildren(self,children)
1104        csElement.__init__(self,**kwargs)
1105
1106class RawFileExtract(FileExtract, csElement):
1107
1108   # Note: Unlike the other file extracts, this sets a self.dataInterface
1109   # attribute, which is used by the overridden getData to determine which
1110   # Data Interface is used to read the file. This is necessary because the
1111   # getUnknownDataInterface() method determines which DI to use based on
1112   # filename suffix (raw files could be called anything) or by inspecting
1113   # the file (raw files have no magic numbers or other markers that could
1114   # be used to unequivocally determine the file type).
1115   def __init__(self,**kwargs):
1116      FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1117      elems=['endianness', 'fillValue']
1118      addelems(self,elems)
1119      children={elems[0]:[CSML('endianness'), 'csString'],elems[1]:[CSML('fillValue'), 'csString']}
1120      addchildren(self,children)
1121      csElement.__init__(self,**kwargs)
1122      self.dataInterface = csml.csmllibs.csmldataiface.RawFileInterface
1123 
1124class ImageFileExtract(RawFileExtract, csElement):
1125   def __init__(self,**kwargs):
1126      FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1127      elems=['fillValue']
1128      addelems(self,elems)
1129      children={elems[0]:[CSML('fillValue'), 'csString']}
1130      addchildren(self,children)
1131      csElement.__init__(self,**kwargs)
1132      self.dataInterface = csml.csmllibs.csmldataiface.ImageFileInterface
1133   
1134
1135class SimpleCondition(csElement): 
1136    '''from moles'''
1137    def __init__(self,**kwargs):
1138        addatts(self, [])
1139        elems= ['dgAttributeAuthority', 'attrauthRole']
1140        addelems(self,elems)
1141        children={elems[0]:[MOLES('dgAttributeAuthority'), 'csString'],elems[1]:[MOLES('attrauthRole'), 'csString']}
1142        addchildren(self,children)
1143        csElement.__init__(self, **kwargs)
1144
1145
1146class ComplexCondition(csElement): 
1147    '''from moles (stub class)'''
1148    def __init__(self,**kwargs):
1149        addatts(self, [])
1150        elems= []
1151        addelems(self,elems)
1152        children={}
1153        addchildren(self,children)
1154        csElement.__init__(self, **kwargs)
1155
1156class DgSecurityCondition(csElement): 
1157    '''from moles'''
1158    def __init__(self,**kwargs):
1159        addatts(self, [])
1160        elems=['effect', 'conditionExplanationText', 'simpleCondition', 'complexCondition']
1161        addelems(self,elems)
1162        children={elems[0]:[MOLES('effect'), 'csString'],elems[1]:[MOLES('conditionExplanationText'),'csString'],elems[2]:[MOLES('simpleCondition'), 'SimpleCondition'],elems[3]:[MOLES('complexCondition'), 'ComplexCondition']}
1163        addchildren(self,children)
1164        csElement.__init__(self,**kwargs)
1165
1166class AccessControlPolicy(csElement):
1167    def __init__(self,**kwargs):
1168        addatts(self,[])
1169        elems=['accessControlPolicyURL', 'accessControlPolicyText', 'dgSecurityCondition']     
1170        addelems(self,elems)
1171        children={elems[0]:[CSML('accessControlPolicyURL'), 'csString'],elems[1]:[CSML('accessControlPolicyText'),'csString'],elems[2]:[CSML('dgSecurityCondition'), 'DgSecurityCondition']}
1172        addchildren(self,children)
1173        csElement.__init__(self,**kwargs)
1174       
1175class CSMLStorageDescriptor(csElement):
1176    def __init__(self,**kwargs):
1177        addatts(self,[])
1178        elems=['descriptors']
1179        addelems(self,elems)
1180        children={elems[0]:[[CSML('NetCDFExtract'),CSML('AggregatedArray'), CSML('RawFileExtract')], 'FileExtract', CSML('descriptor'),1]}
1181        addchildren(self,children)
1182        csElement.__init__(self,**kwargs)
1183
1184class CSMLFeatureCollection(AbstractFeatureCollection,csElement,):
1185    def __init__(self,**kwargs):
1186        AbstractFeatureCollection.__init__(self,**kwargs)
1187        elems=['featureMembers']
1188        addelems(self,elems)
1189        children={elems[0]:[[CSML('GridFeature'), CSML('GridSeriesFeature'),CSML('PointFeature'),CSML('TrajectoryFeature'),CSML('ProfileFeature'),CSML('ProfileSeriesFeature'),CSML('RaggedProfileSeriesFeature'),CSML('RaggedSectionFeature'),CSML('SectionFeature'),CSML('ScanningRadarFeature'),CSML('PointSeriesFeature'),CSML('AlternatePointFeature')], 'AbstractFeature', CSML('featureMember'),1]}
1190        addchildren(self,children)
1191        csElement.__init__(self,**kwargs)
1192    def _getSubstitutionType(self,tag):
1193        if tag==CSML('GridFeature'):
1194            return 'GridFeature'
1195        elif tag==CSML('GridSeriesFeature'):
1196            return 'GridSeriesFeature'
1197        elif tag==CSML('PointFeature'):
1198            return 'PointFeature'
1199        elif tag==CSML('TrajectoryFeature'):
1200            return 'TrajectoryFeature'
1201        elif tag==CSML('PointSeriesFeature'):
1202            return 'PointSeriesFeature'
1203        elif tag==CSML('ProfileFeature'):
1204            return 'ProfileFeature'
1205        elif tag==CSML('ProfileSeriesFeature'):
1206            return 'ProfileSeriesFeature'
1207        elif tag==CSML('RaggedProfileSeriesFeature'):
1208            return 'RaggedProfileSeriesFeature'
1209        elif tag==CSML('RaggedSectionFeature'):
1210            return 'RaggedSectionFeature'
1211        elif tag==CSML('SectionFeature'):
1212            return 'SectionFeature'
1213        elif tag==CSML('ScanningRadarFeature'):
1214            return 'ScanningRadarFeature'
1215        elif tag==CSML('AlternatePointFeature'):
1216            return 'AlternatePointFeature'
1217        else: return 'AbstractFeature'
1218    def _getReverseSubsType(self, typename):
1219        if typename== 'GridFeature':
1220            return CSML('GridFeature')
1221        elif typename == 'GridSeriesFeature':
1222            return CSML('GridSeriesFeature')
1223        elif typename == 'PointSeriesFeature':
1224            return CSML('PointSeriesFeature')
1225        elif typename == 'ProfileFeature':
1226            return CSML('ProfileFeature')
1227        elif typename == 'ProfileSeriesFeature':
1228            return CSML('ProfileSeriesFeature')
1229        elif typename == 'SectionFeature':
1230            return CSML('SectionFeature')
1231        elif typename == 'ScanningRadarFeature':
1232            return CSML('ScanningRadarFeature')
1233        elif typename == 'RaggedSectionFeature':
1234            return CSML('RaggedSectionFeature')
1235        elif typename == 'RaggedProfileSeriesFeature':
1236            return CSML('RaggedProfileSeriesFeature')
1237        elif typename == 'PointFeature':
1238            return CSML('PointFeature')
1239        elif typename == 'TrajectoryFeature':
1240            return CSML('TrajectoryFeature')
1241        elif typename == 'AlternatePointFeature':
1242            return CSML('AlternatePointFeature')
1243        else: return CSML('AbstractFeature')
1244
1245       
1246class Dataset(csElement):   
1247    ''' Dataset class, needed as root of tree'''
1248    def __init__(self, **kwargs):
1249        a=['id']
1250        addatts(self,a)
1251        elems=['name','accessControlPolicy','featureCollection','storageDescriptor']
1252        addelems(self,elems)
1253        children = {elems[0]:[CSML('name') ,'csString'], elems[1]:[CSML('AccessControlPolicy') ,'AccessControlPolicy'], elems[2]:[CSML('CSMLFeatureCollection') ,'CSMLFeatureCollection'],elems[3]:[CSML('CSMLStorageDescriptor'),'CSMLStorageDescriptor']}
1254        addchildren(self,children)
1255        csElement.__init__(self,**kwargs)
1256   
1257    def toXML(self):
1258        csmlfrag=ET.Element(CSML('Dataset'))
1259        csElement.toXML(self, csmlfrag)
1260        return csmlfrag
1261    #def _getSubstitutionType(self,tag): 
1262        #if tag==CSML('NetCDFExtract'):
1263            #return 'NetCDFExtract'
1264        #elif tag==CSML('NASAAmesExtract'):
1265            #return 'NASAAmesExtract'
1266        #else: return 'ArrayDescriptor'
1267    #def _getReverseSubsType(self, typename):
1268        #if typename== 'NetCDFExtract':
1269            #return CSML('NetCDFExtract')
1270        #elif typename == 'NASAAmesExtract':
1271            #return CSML('NASAAmesExtract')
1272        #else: return CSML('ArrayDescriptor')
1273       
1274        return typename
1275
1276   
1277def main():
1278    '''round trip for testing purposes:'''
1279    import parser_extra
1280    print '\n'
1281    #tree=ET.ElementTree(file='/home/dom/coapec/TESTocean.xml')
1282    tree=ET.ElementTree(file='/home/dom/CSTEST/testout.xml')
1283    import time
1284    time1=time.time()
1285    #ds=Dataset()
1286    ds=csml.parser.Dataset()
1287    ds.fromXML(tree.getroot()) 
1288    #ds =csml.parser_extra.ParserPostProcessor(ds).resolveReferences()
1289    print 'time=',time.time()-time1
1290   
1291    csmltree=ds.toXML()   
1292    csmlout=parser_extra.PrettyPrint(csmltree)
1293    csmlout=parser_extra.removeInlineNS(csmlout)
1294    f=open('temp.xml', 'w')
1295    f.write(csmlout)
1296    f.close()
1297       
1298    print 'time=',time.time()-time1
1299    print '\n %s'% csmlout
1300    #for member in ds.featureCollection.members:
1301      #print dir(member.value)
1302       
1303
1304if __name__=='__main__':
1305    #import profile
1306    #profile.run('main()')
1307    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.