source: TI02-CSML/trunk/csml/parser.py @ 2683

Subversion URL: http://proj.badc.rl.ac.uk/svn/ndg/TI02-CSML/trunk/csml/parser.py@2683
Revision 2683, 54.8 KB checked in by domlowe, 14 years ago (diff)

parsing from elementree (parseElemTree) method added, and speeded up getAttr method

Line 
1#import cElementTree as ET
2#import elementtree.ElementTree as etree
3try: #python 2.5
4    from xml.etree import ElementTree as etree
5except ImportError:
6    try:
7        # if you've installed it yourself it comes this way
8        import ElementTree as etree
9    except ImportError:
10        # if you've egged it this is the way it comes
11        from elementtree import ElementTree as etree
12
13try: #python 2.5
14    from xml.etree import cElementTree as ET
15except ImportError:
16    try:
17        # if you've installed it yourself it comes this way
18        import cElementTree as ET
19    except ImportError:
20        # if you've egged it this is the way it comes
21        from celementtree import cElementTree as ET
22
23import sys, traceback
24import csml
25'''CSML v2 Parser ''' 
26
27etree._namespace_map.update({'http://www.opengis.net/om': 'om', 'http://www.opengis.net/swe': 'swe',  'http://www.opengis.net/gml': 'gml','http://ndg.nerc.ac.uk/csml' : 'csml', 'http://www.w3.org/1999/xlink':'xlink'})
28
29nsCSML = 'http://ndg.nerc.ac.uk/csml'
30nsGML = 'http://www.opengis.net/gml'
31nsOM = 'http://www.opengis.net/om'
32nsXLINK = 'http://www.w3.org/1999/xlink'
33nsXML = 'http://ndg.nerc.ac.uk/csml'
34nsMOLES='http://ndg.nerc.ac.uk/moles'
35nsSWE='http://www.opengis.net/swe'
36
37MAINATTRIBUTELIST=[]
38
39def CSML(tag):
40    return "{"+nsCSML+"}"+tag
41
42def GML(tag):
43    return "{"+nsGML+"}"+tag
44
45def SWE(tag):
46    return "{"+nsSWE+"}"+tag
47
48def XLINK(tag):
49    return "{"+nsXLINK+"}"+tag
50
51def MOLES(tag):
52    return "{"+nsMOLES+"}"+tag
53
54
55def addchildren(obj, dict):
56    ''' merges (adds) dictionary to existing self.CHILDREN dictionary '''
57    dict1 = dict
58    if hasattr(obj, 'CHILDREN'):
59      dict2=obj.CHILDREN
60    else:
61      dict2={}
62    dict3={}
63    for item in dict1:
64        dict3[item] =dict1[item]
65    for item in dict2:
66        dict3[item] =dict2[item]
67    obj.CHILDREN=dict3
68   
69
70def addatts(obj, atts):
71  ''' merges self.ATTRIBUTES  of inherited classes'''
72  if hasattr(obj, 'ATTRIBUTES'):
73    for att in atts:
74        obj.ATTRIBUTES.append(att)
75        if att not in MAINATTRIBUTELIST:
76            MAINATTRIBUTELIST.append(att)
77  else:
78    obj.ATTRIBUTES=atts
79 
80
81def addelems(obj, elems):
82  ''' merges self.elems of inherited classes'''
83  if hasattr(obj, 'ELEMORDER'):
84    for elem in elems:
85        obj.ELEMORDER.append(elem)
86  else:
87    obj.ELEMORDER=elems
88
89
90#Some variable definitions: these things are often repeated so store in variables.
91FILEFORMATS=[CSML('NetCDFExtract'),CSML('NASAAmesExtract'), CSML('GRIBExtract'),CSML('CDMLExtract'), CSML('RawFileExtract'), CSML('ImageFileExtract'), CSML('AggregatedArray')]
92
93
94class csElement(object):
95    ''' main csElement class - all other elements inherit from this baseclass 
96    all the from/to XML conversion is done by this class'''
97   
98    def __init__(self, **kwargs):
99        for kw in kwargs:
100            self.__setattr__(kw, kwargs[kw])
101        if not hasattr(self, 'ATTRIBUTES'):
102            self.__dict__['ATTRIBUTES']=[]
103        if not hasattr(self, 'ELEMORDER'):
104            self.__dict__['ELEMORDER']=[]       
105        if not hasattr(self, 'CHILDREN'):
106            self.__dict__['CHILDREN']={}
107    #The __setattr__ and __getattribute__ special methods have been overridden.
108    #This is so that attributes can be called by their fully qualified name internally
109    #while being referenced by their short name externally.
110    # so 'id' and {'http://www.opengis.net/gml'}id always have the same value
111    #you can set either of them at any time and the other will be kept in sync.
112       
113    def __setattr__(self, name, value):
114        if hasattr(self, CSML(name)):
115            object.__setattr__(self, CSML(name), value)
116            object.__setattr__(self, name, value)
117        elif hasattr(self,GML(name)):
118            object.__setattr__(self, GML(name), value)
119            object.__setattr__(self, name, value)
120        elif hasattr(self,XLINK(name)):
121            object.__setattr__(self, XLINK(name), value)
122            object.__setattr__(self, name, value)
123        else:
124            if hasattr(self, 'ATTRIBUTES'):
125                if CSML(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
126                    object.__setattr__(self, CSML(name), value)
127                    object.__setattr__(self, name, value)
128                elif GML(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
129                    object.__setattr__(self, GML(name), value)
130                    object.__setattr__(self, name, value)
131                elif XLINK(name) in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
132                    object.__setattr__(self, XLINK(name), value)
133                    object.__setattr__(self, name, value)
134                elif name in self.__dict__['ATTRIBUTES']:
135                    object.__setattr__(self, name, value)
136                    try:
137                        name=name.split('}')[1]
138                    except IndexError:
139                        pass
140                    object.__setattr__(self, name, value)
141                else:
142                    object.__setattr__(self, name, value)
143            else:
144                    object.__setattr__(self, name, value)
145   
146    def __getattribute__(self, name):
147        if name in MAINATTRIBUTELIST:
148            if CSML(name) in object.__dict__:
149                return object.__getattribute__(self,CSML(name))
150            elif GML(name) in object.__dict__:
151                return object.__getattribute__(self,GML(name))
152            elif XLINK(name) in object.__dict__:
153                return object.__getattribute__(self,XLINK(name))
154            else:
155                return object.__getattribute__(self,name) 
156        else:
157            return object.__getattribute__(self,name)
158   
159    def __removeURI(self, qname):
160        try:
161            attname = qname.split('}')[1]
162        except IndexError:
163            attname = qname
164        return attname
165       
166    def _getSubstitutionType(self,tag):
167        return tag.split('}')[1]
168       
169   
170    def _getReverseSubsType(self, typename):
171        return typename
172   
173    def addChildElem(self, childname, childobj):
174        #sometimes you want to add a child element but don't know if there is one already. In which case you want to create a list of child objects.
175        if hasattr(self, childname):
176            currentattribute=getattr(self,childname)
177            if type(getattr(self,childname)) is list:
178                currentattribute.append(childobj)
179            else:
180                newlist=[currentattribute]
181                newlist.append(childobj)
182                setattr(self,childname, newlist)
183        else:
184            setattr(self,childname, childobj)
185
186    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
187        #process self and convert to XML     
188        if hasattr(self, 'CONTENT'):
189            if self.CONTENT is not None: csmlfrag.text=self.CONTENT
190        if hasattr(self, 'ATTRIBUTES'):
191            for item in self.__dict__:
192                if item in self.ATTRIBUTES:                   
193                    csmlfrag.set(item, self.__dict__[item])
194    # self.CHILDREN (recursive - calls the toXML method of children
195        for child in self.ELEMORDER:
196            if not self.__dict__.has_key(child):
197                continue
198            appendLater=False
199            parserobjects=[]
200            if type(self.__dict__[child]) is list:
201                for a in self.__dict__[child]:
202                    parserobjects.append(a)
203            else:
204                parserobjects.append(self.__dict__[child])
205            parentfrag=None
206            if len(self.CHILDREN[child])>=3:
207                    ename2=self.CHILDREN[child][2]
208                    parentfrag=ET.Element(ename2)
209            for po in parserobjects:
210                if type(self.CHILDREN[child][0]) is not list:
211                    ename=self.CHILDREN[child][0]
212                else:
213                    ename = self._getReverseSubsType(type(po).__name__)
214                if len(self.CHILDREN[child])==3:
215                    frag=ET.Element(ename)
216                    po.toXML(frag)
217                    parentfrag.append(frag)
218                    appendLater=True
219                elif len(self.CHILDREN[child])>=4:
220                    if self.CHILDREN[child][3]==1:
221                        frag=ET.Element(ename)
222                        po.toXML(frag)
223                        parentfrag.append(frag)
224                        csmlfrag.append(parentfrag)
225                        parentfrag=ET.Element(parentfrag.tag)
226                        appendLater=False
227                else:
228                    frag=ET.Element(ename)
229                    try:
230                        po.toXML(frag)
231                    except:
232                        print 'PARSING ERROR - could not convert %s to XML'%frag
233                        print dir(ename)
234                        raise
235                    csmlfrag.append(frag)
236                    appendLater=True
237
238                if appendLater==True and parentfrag != None:             
239                    csmlfrag.append(parentfrag)   
240
241        return csmlfrag
242       
243    def fromXML(self,csmlfrag):
244        # deal with attributes, e.g. gml id's
245        if csmlfrag.text is not None:
246                self.CONTENT = csmlfrag.text
247        for item in csmlfrag.items():
248            if item[0] in self.ATTRIBUTES:
249                setattr(self, item[0], item[1])
250        #self.CHILDREN (recursive - calls the fromXML method of children
251        for frag in csmlfrag[:]:
252            #for each child element
253            #iterate through expected CHILDREN to find match
254            for child in self.CHILDREN:
255                if len(self.CHILDREN[child])>=3:
256                    ename = self.CHILDREN[child][2]
257                    ename2 = self.CHILDREN[child][0]
258                else:
259                    ename = self.CHILDREN[child][0] 
260                    ename2=None
261                #if there are options, then find the name that matches the frag
262                if ename2 is not None:
263                    if frag[:] != []:
264                        for subfrag in frag[:]:
265                            etype=None
266                            if type(ename2) is list:
267                                if subfrag.tag in ename2:
268                                    etype=self._getSubstitutionType(subfrag.tag)
269                            if subfrag.tag==ename2:
270                                etype=self.CHILDREN[child][1]
271                            if etype:
272                                childobj=eval(etype)()
273                                if len(self.CHILDREN[child])>=3:
274                                    if frag[:] != []:
275                                        childobj.fromXML(subfrag)
276                                else:
277                                    childobj.fromXML(frag)
278                                #set this object to be an attribute of the 'parent' (self) object
279                                if hasattr(self, child):
280                                    if type(self.__dict__[child]) is not list:
281                                        tmp=self.__dict__[child]
282                                        setattr(self, child, [tmp]) #convert to list
283                                    self.__dict__[child].append(childobj)
284                                else:
285                                    setattr(self, child, childobj)
286                else:
287                    etype=None
288                    if type(ename) is list:
289                        if frag.tag in ename:
290                            etype=self._getSubstitutionType(frag.tag)
291                    elif frag.tag==ename:
292                        etype=self.CHILDREN[child][1]
293                    if etype:
294                        childobj=eval(etype)()
295                        if len(self.CHILDREN[child])>=3:
296                            if frag[:] != []:
297                                childobj.fromXML(frag[0])
298                        else:
299                            childobj.fromXML(frag)
300                           
301                        #set this object to be an attribute of the 'parent' (self) object
302                        if hasattr(self, child):
303                            if type(self.__dict__[child]) is not list:
304                                tmp=self.__dict__[child]
305                                setattr(self, child, [tmp]) #convert to list
306                            self.__dict__[child].append(childobj)
307                        else:
308                            setattr(self, child, childobj)
309
310               
311   
312class AbstractGML(csElement):
313    def __init__(self, **kwargs):
314        a=[GML('id')]
315        addatts(self,a)
316        elems=['metaDataProperty', 'description','name']
317        addelems(self,elems)
318        children={elems[0]:[GML('metaDataProperty'),'csString'],elems[1]:[GML('description'),'csString'],elems[2]:[GML('name'),'csString']}
319        addchildren(self,children)
320        csElement.__init__(self,**kwargs)
321       
322class AssociationAttributeGroup(csElement):
323    def __init__(self, **kwargs):
324        a =[XLINK('href'),XLINK('role'), XLINK('arcrole'),XLINK('title'), XLINK('show'), XLINK('actuate')] 
325        addatts(self,a)
326        csElement.__init__(self,**kwargs)
327       
328class csString(AssociationAttributeGroup, csElement):
329    def __init__(self, text=None,**kwargs):
330        #Needed so it can use xlink
331        addelems(self,[])
332        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
333        if text != None:
334            if type(text) is not str:
335                text=str(text)
336            self.CONTENT=text
337        children={}
338        addchildren(self,children)
339        csElement.__init__(self,**kwargs)
340       
341class SRSReferenceGroup(csElement):
342    def __init__(self, **kwargs):
343        a =['srsName','srsDimension'] 
344        addatts(self,a)
345        csElement.__init__(self,**kwargs)
346               
347class SRSInformationGroup(csElement):
348    def __init__(self, **kwargs):
349        a =['uomLabels','axisLabels']
350        addatts(self,a)
351        csElement.__init__(self,**kwargs)
352       
353class ArrayDescriptor(csElement):
354    def __init__(self,**kwargs):
355        a=['id']
356        addatts(self,a)
357        elems=['arraySize', 'uom', 'numericType','regExpTransform','numericTransform']
358        addelems(self,elems)
359        children={elems[0]:[CSML('arraySize'), 'csString'], elems[1]:[CSML('uom'),'csString'], elems[2]:[CSML('numericType'),'csString'], elems[3]:[CSML('regExpTransform'),'csString'], elems[4]:[CSML('numericTransform'),'csString']}
360        addchildren(self,children)
361        csElement.__init__(self,**kwargs)
362               
363class GridEnvelope(AbstractGML,SRSReferenceGroup, csElement):
364    def __init__(self, **kwargs):
365        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
366        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
367        elems=['low', 'high']
368        addelems(self,elems)
369        children={elems[0]:[GML('low'), 'csString'],elems[1]:[GML('high'), 'csString']}
370        addchildren(self,children)
371        csElement.__init__(self,**kwargs)
372       
373class Envelope(AbstractGML,SRSReferenceGroup, csElement):
374    def __init__(self, **kwargs):
375        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
376        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
377        elems=['lowerCorner','upperCorner']
378        addelems(self,elems)
379        children={elems[0]:[GML('lowerCorner'), 'csString'],elems[1]:[GML('upperCorner'), 'csString']}
380        addchildren(self,children)
381        csElement.__init__(self,**kwargs)
382       
383class EnvelopeWithTimePeriod(Envelope):
384    def __init__(self, **kwargs):
385        Envelope.__init__(self,**kwargs)
386        elems=['beginPosition', 'endPosition']
387        addelems(self,elems)
388        children={elems[0]:[GML('beginPosition'), 'csString'], elems[1]:[GML('endPosition'), 'csString']}
389        addchildren(self,children)
390        csElement.__init__(self,**kwargs)
391
392class AbstractFeature(AbstractGML,csElement):
393    def __init__(self, **kwargs):
394        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
395        elems=['boundedBy']
396        addelems(self,elems)
397        #this pattern works but can only accept EnvelopeWithTimePeriod for the boundedBy,
398        #which is probably ok   
399        children={elems[0]:[GML('EnvelopeWithTimePeriod'), 'EnvelopeWithTimePeriod', GML('boundedBy')]}
400        addchildren(self,children)
401        csElement.__init__(self,**kwargs)
402       
403class AbstractFeatureCollection(AbstractFeature,csElement):
404    def __init__(self, **kwargs):
405        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
406        csElement.__init__(self,**kwargs)
407       
408class DomainSet(AbstractGML,AssociationAttributeGroup,csElement):
409    def __init__(self, **kwargs):
410        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
411        addchildren(self,{})
412        csElement.__init__(self,**kwargs)
413       
414class AggregatedArray(ArrayDescriptor,csElement):
415    def __init__(self, **kwargs):
416        ArrayDescriptor.__init__(self,**kwargs)
417        elems=['aggType', 'aggIndex', 'components']
418        addelems(self,elems)
419        children={elems[0]:[CSML('aggType'),'csString'], elems[1]:[CSML('aggIndex'),'csString'],elems[2]:[FILEFORMATS, 'ArrayDescriptor',CSML('component')]}
420        addchildren(self,children)
421        csElement.__init__(self,**kwargs)
422#'component':[CSML:('component'), 'ArrayDescriptor', CSML('component')],
423
424class MeasureOrNullList(AbstractGML,AssociationAttributeGroup, csElement):
425    def __init__(self, **kwargs):
426        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
427        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
428        elems=['insertedExtract']
429        addelems(self,elems)
430        #note insertedExtract is used in resolving xlinks and shouldn't be written to directly (except by the code which handles the xlink resolutions)
431        children={elems[0]:[FILEFORMATS,'FileExtract',CSML('insertedExtract')]}
432        addchildren(self,children)
433        a =['uom'] 
434        addatts(self,a)
435        csElement.__init__(self,**kwargs)
436       
437    def toXML(self,csmlfrag,**kwargs):
438        temp=None
439        if hasattr(self, 'insertedExtract'):         
440            temp=self.insertedExtract
441            del self.insertedExtract  #don't want to expose this in XML       
442        csmlfrag=csElement.toXML(self,csmlfrag, **kwargs)
443        if temp is not None:
444            self.insertedExtract=temp
445        return csmlfrag
446       
447       
448class CompositeValue(AbstractGML,csElement):
449    def __init__(self, **kwargs):
450        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
451        elems=['measures']
452        addelems(self,elems)
453        children={elems[0]:[GML('measure'),'csString',GML('valueComponents')]}
454        addchildren(self,children)
455        csElement.__init__(self,**kwargs)
456       
457class DataBlock(AbstractGML,csElement):
458    #THIS IS INCOMPLETE
459    def __init__(self, **kwargs):
460        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
461        elems=['doubleOrNullTupleList','rangeParameters']
462        addelems(self,elems)
463        children={elems[0]:[GML('doubleOrNullTupleList'),'csString'],elems[1]:[GML('CompositeValue'), 'CompositeValue', GML('rangeParameters')]}
464        addchildren(self,children)
465        csElement.__init__(self,**kwargs)
466
467class ValueArray(AbstractGML, csElement):
468    def __init__(self, **kwargs):
469        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
470        elems=['valueComponent']
471        addelems(self,elems)
472        children=children={elems[0]:[GML('QuantityList'), 'MeasureOrNullList', GML('valueComponent')]}
473        addchildren(self,children)
474        csElement.__init__(self,**kwargs)
475       
476    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
477        csmlfrag=AbstractGML.toXML(self, csmlfrag,**kwargs)
478        #promote XLinks up from QuantityList
479        #this all done at the elementtree level
480       
481        for frag in csmlfrag:
482            if frag.tag ==GML('valueComponent'):
483                try:       
484                    frag.set(XLINK('href'),self.valueComponent.href)                               
485                    for subfrag in frag:   
486                        del subfrag.attrib[XLINK('href')]                                                             
487                except:
488                    pass
489                try:       
490                    frag.set(XLINK('show'),self.valueComponent.show)                               
491                    for subfrag in frag:   
492                        del subfrag.attrib[XLINK('show')]                                                             
493                except:
494                    pass
495                try:       
496                    frag.set(XLINK('role'),self.valueComponent.role)                               
497                    for subfrag in frag:   
498                        del subfrag.attrib[XLINK('role')]                                                             
499                except:
500                    pass
501                try:       
502                    frag.set(XLINK('arcrole'),self.valueComponent.arcrole)                               
503                    for subfrag in frag:   
504                        del subfrag.attrib[XLINK('arcrole')]                                                             
505                except:
506                    pass
507        return csmlfrag
508               
509    def fromXML(self, csmlfrag):   
510        #promote xlinks up a level to the  property element
511        for frag in csmlfrag:
512            if frag.tag == GML('valueComponent'):             
513                for att in ['href', 'show', 'role', 'arcrole']:
514                    try: 
515                        for subfrag in frag[:]:
516                            subfrag.set(XLINK(att),frag.attrib[XLINK(att)])     
517                    except:
518                        pass
519        csElement.fromXML(self, csmlfrag)       
520
521class RangeSet(AbstractGML,AssociationAttributeGroup,csElement):
522    def __init__(self, **kwargs):
523        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
524        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
525        elems=['quantityList', 'dataBlock', 'arrayDescriptor', 'valueArray']
526        addelems(self,elems)
527        children={elems[0]:[GML('QuantityList'), 'MeasureOrNullList'],        elems[1]:[GML('DataBlock'),'DataBlock'],elems[2]:[FILEFORMATS, 'ArrayDescriptor'],  elems[3]:[CSML('AggregatedArray'), 'AggregatedArray'],
528        elems[3]:[GML('ValueArray'),'ValueArray']}
529        addchildren(self,children)
530        csElement.__init__(self,**kwargs)
531       
532class MultiPoint(AbstractGML, SRSReferenceGroup,csElement):
533    def __init__(self, **kwargs):
534        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
535        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
536        elems=['pointMember','pointMembers']
537        addelems(self,elems)
538        children={elems[0]:[GML('pointMember'), 'csString'],elems[1]:[GML('pointMembers'), 'csString']}
539        addchildren(self,children)
540        csElement.__init__(self,**kwargs)
541       
542class Point(AbstractGML,SRSReferenceGroup,csElement):
543    def __init__(self, **kwargs):
544        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
545        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
546        elems=['pos','coordinates']
547        addelems(self,elems)
548        children={elems[0]:[GML('pos'), 'csString'],elems[1]:[GML('coordinates'), 'csString']}
549        addchildren(self,children)
550        csElement.__init__(self,**kwargs)
551       
552class PointDomain(DomainSet, MultiPoint,csElement):
553    def __init__(self, **kwargs):
554        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
555        MultiPoint.__init__(self,**kwargs)
556        children={}
557        addchildren(self,children)
558        csElement.__init__(self,**kwargs)
559       
560class ProfileDomain(DomainSet, MultiPoint,csElement):
561    def __init__(self, **kwargs):
562        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
563        MultiPoint.__init__(self,**kwargs)
564        children={}
565        addchildren(self,children)
566        csElement.__init__(self,**kwargs)
567
568
569class AbstractCoverage(AbstractFeature, csElement):
570    def __init__(self, **kwargs):
571        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
572        csElement.__init__(self,**kwargs)
573       
574class AbstractDiscreteCoverage(AbstractCoverage, csElement):
575    def __init__(self, **kwargs):
576        AbstractCoverage.__init__(self,**kwargs)
577        addchildren(self,{})
578        csElement.__init__(self,**kwargs)
579       
580class Definition(AbstractGML):
581    def __init__(self, **kwargs):
582        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
583        addchildren(self,{})
584        csElement.__init__(self,**kwargs)
585       
586class Phenomenon(Definition,AssociationAttributeGroup):
587    def __init__(self, **kwargs):
588        Definition.__init__(self,**kwargs)
589        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
590        children = {'':[CSML(''), '']}   
591        addchildren(self,children)
592        csElement.__init__(self,**kwargs)
593               
594class SpatialOrTemporalPositionList(AssociationAttributeGroup, AbstractGML,  csElement):
595    def __init__(self, **kwargs):
596        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
597        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
598        elems=['coordinateList', 'timePositionList','insertedExtract']
599        addelems(self,elems)
600        children={elems[0]:[CSML('coordinateList'),'csString'], elems[1]:[CSML('timePositionList'),'TimePositionList'],elems[2]:[FILEFORMATS,'FileExtract',CSML('insertedExtract')]}
601        addchildren(self,children)
602        csElement.__init__(self,**kwargs)
603   
604    def toXML(self,csmlfrag,**kwargs):
605        temp=None
606        if hasattr(self, 'insertedExtract'):
607            temp=self.insertedExtract
608            del self.insertedExtract  #don't want to expose this in XML       
609        csmlfrag=csElement.toXML(self,csmlfrag, **kwargs)
610        #This is mandatory even if empty when using xlink       
611        if not hasattr(self, 'timePositionList'):
612            if not hasattr(self, 'coordinateList'):
613                 if csmlfrag.get(XLINK('arcrole')) is not None:
614                    if csmlfrag.get(XLINK('arcrole')).split('#')[1] == 'timePositionList':
615                        ET.SubElement(csmlfrag, CSML('timePositionList'))
616                    elif csmlfrag.get(XLINK('arcrole')).split('#')[1] =='coordinateList':
617                        ET.SubElement(csmlfrag, CSML('coordinateList'))                       
618        if temp !=None:
619            self.insertedExtract=temp
620        return csmlfrag
621
622class GridOrdinateDescription(AbstractGML,csElement):
623    def __init__(self, **kwargs):
624        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
625        elems=['coordAxisLabel', 'coordAxisValues', 'gridAxesSpanned', 'sequenceRule']
626        addelems(self,elems)
627        children={elems[0]:[CSML('coordAxisLabel'), 'csString'], elems[1]:[CSML('SpatialOrTemporalPositionList'),'SpatialOrTemporalPositionList',CSML('coordAxisValues')], elems[2]:[CSML('gridAxesSpanned'), 'csString'], elems[3]:[CSML('sequenceRule'),'SequenceRule']}
628        addchildren(self,children)
629        csElement.__init__(self,**kwargs)
630    def toXML(self, csmlfrag, **kwargs):
631        csmlfrag=AbstractGML.toXML(self, csmlfrag,**kwargs)
632        #promote XLinks up from SpatialOrTemporalPositionList       
633        #this all done at the elementtree level
634       
635        for frag in csmlfrag:
636            if frag.tag ==CSML('coordAxisValues'):
637                try:       
638                    frag.set(XLINK('href'),self.coordAxisValues.href)                               
639                    for subfrag in frag:   
640                        del subfrag.attrib[XLINK('href')]                                                             
641                except:
642                    pass
643                try:       
644                    frag.set(XLINK('show'),self.coordAxisValues.show)                               
645                    for subfrag in frag:   
646                        del subfrag.attrib[XLINK('show')]                                                             
647                except:
648                    pass
649                try:       
650                    frag.set(XLINK('role'),self.coordAxisValues.role)                               
651                    for subfrag in frag:   
652                        del subfrag.attrib[XLINK('role')]                                                             
653                except:
654                    pass
655                try:       
656                    frag.set(XLINK('arcrole'),self.coordAxisValues.arcrole)                               
657                    for subfrag in frag:   
658                        del subfrag.attrib[XLINK('arcrole')]                                                             
659                except:
660                    pass
661             
662
663        return csmlfrag
664   
665    def fromXML(self, csmlfrag):
666        #promote xlinks up a level to the coordAxisValues property element
667        for frag in csmlfrag:
668            if frag.tag == CSML('coordAxisValues'):             
669                for att in ['href', 'show', 'role', 'arcrole']:
670                    try: 
671                        for subfrag in frag[:]:
672                            subfrag.set(XLINK(att),frag.attrib[XLINK(att)])     
673                    except:
674                        pass
675               
676        csElement.fromXML(self, csmlfrag)
677
678           
679       
680class SequenceRule(csElement):
681    def __init__(self, **kwargs):
682        a=['axisOrder']
683        addatts(self,a)
684        children={}
685        addchildren(self,children)
686        csElement.__init__(self,**kwargs)
687       
688class GridPointDescription(AbstractGML,csElement):
689    def __init__(self, **kwargs):
690        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
691        elems=['posList', 'sequenceRule']
692        addelems(self,elems)
693        children={elems[0]:[CSML('posList'),'csString'],elems[1]:[CSML('sequenceRule'),'SequenceRule']}
694        addchildren(self,children)
695        csElement.__init__(self,**kwargs)
696
697class TimePositionList(AbstractGML,csString,csElement):
698    def __init__(self, **kwargs):
699        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
700        csString.__init__(self, **kwargs)
701        elems=[]
702        addelems(self,elems)
703        a=['frame', 'calendarEraName','indeterminatePosition']
704        addatts(self,a)
705        addchildren(self,{})
706        csElement.__init__(self,**kwargs)
707
708class GridCoordinatesTable(AbstractGML,csElement):
709    def __init__(self,**kwargs):
710        '''the additional value '1' in the children dictionary is used to signify that the elements must be nested as:
711        <gml:ordinate>
712            <gml:GridOrdinateDescription>
713        </gml:ordinate>
714        <gml:ordinate>
715            <gml:GridOrdinateDescription>
716        </gml:ordinate>
717       
718        not as:
719        <gml:ordinate>
720            <gml:GridOrdinateDescription>
721            <gml:GridOrdinateDescription>
722        </gml:ordinate> '''
723        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
724        elems=['gridOrdinates' , 'gridPoints']
725        addelems(self,elems)
726        children={elems[0]:[CSML('GridOrdinateDescription'), 'GridOrdinateDescription',CSML('gridOrdinate'),1], elems[1]:[CSML('GridPointDescription'),'GridPointDescription',CSML('gridPoints')]}
727        addchildren(self,children)
728        csElement.__init__(self,**kwargs)
729       
730class Grid(AbstractGML, AssociationAttributeGroup, SRSInformationGroup, SRSReferenceGroup, csElement):
731    def __init__(self, **kwargs):
732        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
733        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)
734        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
735        SRSInformationGroup.__init__(self,**kwargs)
736        a=['dimension']
737        addatts(self,a)
738        elems=['limits', 'aLabels','axisName']
739        addelems(self, elems)
740        children = {elems[1]:[CSML('axisLabels'),'csString'],elems[2]:[CSML('axisName'),'csString'], elems[0]:[GML('GridEnvelope'),'GridEnvelope',CSML('limits')]}
741        addchildren(self,children)
742        csElement.__init__(self,**kwargs)
743           
744class ReferenceableGrid(Grid, csElement):
745    def __init__(self, **kwargs):
746        Grid.__init__(self,**kwargs)
747        elems=['coordTransformTable']
748        addelems(self,elems)
749        children={elems[0]:[CSML('GridCoordinatesTable'), 'GridCoordinatesTable', CSML('coordTransformTable')]}
750        addchildren(self,children)
751        csElement.__init__(self,**kwargs)
752
753class ReferenceableGridCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
754    def __init__(self, **kwargs):
755        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
756        elems=[referenceableGridDomain]
757        addelems(self,elems)
758        children={elems[0]:[CSML('ReferenceableGrid'),'ReferenceableGrid' ,CSML('referenceableGridDomain') ]}
759        addchildren(self,children)
760        csElement.__init__(self,**kwargs)
761       
762class AlternatePointCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
763    def __init__(self, **kwargs):
764        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
765        elems=['alternatePointDomain','rangeSet','coverageFunction']
766        addelems(self,elems)
767        children={elems[0]:[GML('Point'),'Point', CSML('alternatePointDomain')], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
768        addchildren(self,children)
769        csElement.__init__(self,**kwargs)
770
771class ProfileCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
772    def __init__(self, **kwargs):
773        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
774        elems=['profileDomain', 'rangeSet' ,'coverageFunction']
775        addelems(self,elems)
776        children={elems[0]:[CSML('ProfileDomain'),'ProfileDomain' ,CSML('profileDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
777        addchildren(self,children)
778        csElement.__init__(self,**kwargs)
779       
780class PointCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
781    def __init__(self, **kwargs):
782        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
783        elems=['pointDomain','rangeSet', 'coverageFunction']
784        addelems(self,elems)
785        children={elems[0]:[CSML('PointDomain'),'PointDomain' ,CSML('pointDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
786        addchildren(self,children)
787        csElement.__init__(self,**kwargs)
788       
789class TimeSeries(AbstractGML, csElement):
790    def __init__(self, **kwargs):
791        AbstractGML.__init__(self,**kwargs)
792        elems=['timePositionList']
793        addelems(self,elems)
794        children={elems[0]:[CSML('timePositionList'), 'csString']}
795        addchildren(self,children)
796        csElement.__init__(self,**kwargs)
797
798class PointSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage, csElement):
799    def __init__(self, **kwargs):
800        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
801        elems=['pointSeriesDomain','rangeSet','coverageFunction']
802        addelems(self,elems)
803        children={elems[0]:[CSML('TimeSeries'),'TimeSeries' ,CSML('pointSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
804        addchildren(self,children)
805        csElement.__init__(self,**kwargs)
806       
807class ProfileSeriesDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
808    def __init__(self, **kwargs):
809        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
810        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
811        children={}
812        addchildren(self,children)
813        csElement.__init__(self,**kwargs)
814       
815class ProfileSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
816    def __init__(self, **kwargs):
817        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
818        elems=['profileSeriesDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
819        addelems(self,elems)
820        children={elems[0]:[CSML('ProfileSeriesDomain'),'ProfileSeriesDomain' ,CSML('profileSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
821        addchildren(self,children)
822        csElement.__init__(self,**kwargs)
823       
824class SectionDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
825    def __init__(self, **kwargs):
826        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
827        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
828        children={}
829        addchildren(self,children)
830        csElement.__init__(self,**kwargs)
831       
832class SectionCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
833    def __init__(self, **kwargs):
834        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
835        elems=['sectionDomain', 'rangeSet' , 'coverageFunction']
836        addelems(self,elems)
837        children={elems[0]:[CSML('SectionDomain'),'SectionDomain' ,CSML('sectionDomain') ],elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
838        addchildren(self,children)
839        csElement.__init__(self,**kwargs)
840       
841class TrajectoryDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
842    def __init__(self, **kwargs):
843        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
844        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
845        children={}
846        addchildren(self,children)
847        csElement.__init__(self,**kwargs)
848       
849class TrajectoryCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
850    def __init__(self, **kwargs):
851        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
852        elems=['trajectoryDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
853        addelems(self,elems)
854        children={elems[0]:[CSML('TrajectoryDomain'),'TrajectoryDomain' ,CSML('trajectoryDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
855        addchildren(self,children)
856        csElement.__init__(self,**kwargs)
857
858class ScanningRadarDomain(ReferenceableGrid, DomainSet, csElement):
859    def __init__(self, **kwargs):
860        DomainSet.__init__(self,**kwargs)
861        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
862        children={}
863        addchildren(self,children)
864        csElement.__init__(self,**kwargs)
865       
866class ScanningRadarCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
867    def __init__(self, **kwargs):
868        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
869        elems=['scanningRadarDomain', 'rangeSet','coverageFunction']
870        addelems(self,elems)
871        children={elems[0]:[CSML('ScanningRadarDomain'),'ScanningRadarDomain' ,CSML('scanningRadarDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
872        addchildren(self,children)
873        csElement.__init__(self,**kwargs)
874
875
876class GridSeriesDomain(ReferenceableGrid, csElement):
877    def __init__(self, **kwargs):
878        #DomainSet.__init__(self,**kwargs)
879        ReferenceableGrid.__init__(self,**kwargs)
880        children={}
881        addchildren(self,children)
882        csElement.__init__(self,**kwargs)
883
884class GridSeriesCoverage(AbstractDiscreteCoverage,csElement):
885    def __init__(self, **kwargs):
886        elems=['gridSeriesDomain', 'rangeSet', 'coverageFunction']
887        addelems(self,elems)
888        children={elems[0]:[CSML('GridSeriesDomain'),'GridSeriesDomain' ,CSML('gridSeriesDomain') ], elems[1]:[GML('rangeSet'), 'RangeSet'],elems[2]:[GML('coverageFunction'),'csString']}
889        addchildren(self,children)
890        AbstractDiscreteCoverage.__init__(self,**kwargs)
891        csElement.__init__(self,**kwargs)
892
893class AlternatePointFeature(AbstractFeature, csElement):
894    def __init__(self, **kwargs):
895        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
896        elems=['location', 'time', 'value','parameter']
897        addelems(self,elems)
898        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('AlternatePointCoverage'), 'AlternatePointCoverage', CSML('value')],elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
899        addchildren(self,children)
900        csElement.__init__(self,**kwargs)
901
902class DirectPositionList(SRSReferenceGroup, csElement):
903    def __init__(self, **kwargs):
904        SRSReferenceGroup.__init__(self,**kwargs)
905        children=[]
906        addchildren(self,children)
907        csElement.__init__(self,**kwargs)
908       
909class PointFeature(AbstractFeature, csElement):
910    def __init__(self, **kwargs):
911        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
912        elems=['location', 'time', 'value','parameter']
913        addelems(self,elems)
914        children={elems[0]:[CSML('location'), 'DirectPositionList'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('PointCoverage'), 'PointCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
915        addchildren(self,children)
916        csElement.__init__(self,**kwargs)
917
918class PointCollectionFeature(AbstractFeature, csElement):
919    def __init__(self, **kwargs):
920        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
921        elems=['time', 'value', 'parameter']
922        addelems(self,elems)
923        children={elems[0]:[CSML('time'), 'csString'], elems[1]:[CSML('MultiPointCoverage'), 'MultiPointCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
924        addchildren(self,children)
925        csElement.__init__(self,**kwargs)
926
927
928class PointSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
929    def __init__(self, **kwargs):
930        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
931        elems=['location','value','parameter']
932        addelems(self,elems)
933        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('PointSeriesCoverage'), 'PointSeriesCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
934        addchildren(self,children)
935        csElement.__init__(self,**kwargs)
936
937
938class GridFeature(AbstractFeature, csElement):
939    def __init__(self, **kwargs):
940        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
941        elems=['time', 'value', 'parameter']
942        addelems(self,elems)
943        children={elems[0]:[CSML('time'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ReferenceableGridCoverage'), 'ReferenceableGridCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
944        addchildren(self,children)
945        csElement.__init__(self,**kwargs)
946
947class GridSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
948    def __init__(self, **kwargs):
949        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
950        elems=['value','parameter']
951        addelems(self,elems)
952        children={elems[0]:[CSML('GridSeriesCoverage'), 'GridSeriesCoverage', CSML('value')],elems[1]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
953        addchildren(self,children)
954        csElement.__init__(self,**kwargs)
955
956class ProfileFeature(AbstractFeature, csElement):
957    def __init__(self, **kwargs):
958        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
959        elems=['location', 'time','value', 'parameter']
960        addelems(self,elems)
961        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'],elems[1]:[CSML('time'), 'csString'], elems[2]:[CSML('ProfileCoverage'), 'ProfileCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
962        addchildren(self,children)
963        csElement.__init__(self,**kwargs)
964
965class ProfileSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
966    def __init__(self, **kwargs):
967        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
968        elems=['location', 'value', 'parameter']
969        addelems(self,elems)
970        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ProfileSeriesCoverage'), 'ProfileSeriesCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
971        addchildren(self,children)
972        csElement.__init__(self,**kwargs)
973
974class RaggedProfileSeriesFeature(AbstractFeature, csElement):
975    def __init__(self, **kwargs):
976        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
977        elems=['location', 'profileLength', 'value', 'parameter']
978        addelems(self,elems)
979        children={elems[0]:[CSML('location'), 'csString'], elems[1]:[CSML('profileLength'), 'csString'],elems[2]:[CSML('ProfileSeriesCoverage'), 'ProfileSeriesCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
980        addchildren(self,children)
981        csElement.__init__(self,**kwargs)
982
983class RaggedSectionFeature(AbstractFeature, csElement):
984    def __init__(self, **kwargs):
985        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
986        elems=['stationLocations', 'stationTimes', 'profileLength' 'value','parameter']
987        addelems(self,elems)
988        children={elems[0]:[CSML('stationLocations'), 'csString'], elems[1]:[CSML('stationTimes'), 'csString'],elems[2]:[CSML('profileLength'),'csString'],elems[3]:[CSML('SectionCoverage'), 'SectionCoverage', CSML('value')], elems[4]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
989        addchildren(self,children)
990        csElement.__init__(self,**kwargs)
991
992class SectionFeature(AbstractFeature, csElement):
993    def __init__(self, **kwargs):
994        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
995        elems=['stationLocations', 'stationTimes','value', 'parameter']
996        addelems(self,elems)
997        children={elems[0]:[CSML('stationLocations'), 'csString'], elems[1]:[CSML('stationTimes'), 'TimePositionList'],elems[2]:[CSML('SectionCoverage'), 'SectionCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
998        addchildren(self,children)
999        csElement.__init__(self,**kwargs)
1000
1001class ScanningRadarFeature(AbstractFeature, csElement):
1002    def __init__(self, **kwargs):
1003        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1004        elems=['elevation','value', 'parameter']
1005        addelems(self,elems)
1006        children={elems[0]:[CSML('elevation'), 'csString'], elems[1]:[CSML('ScanningRadarCoverage'), 'ScanningRadarCoverage', CSML('value')], elems[2]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1007        addchildren(self,children)
1008        csElement.__init__(self,**kwargs)
1009
1010       
1011class SwathFeature(AbstractFeature, csElement):
1012    def __init__(self, **kwargs):
1013        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1014        elems=['eqCrossLon', 'eqCrossTime', 'value', 'parameter']
1015        addelems(self,elems)
1016        children={elems[0]:[CSML('eqCrossLon'), 'csString'],elems[1]:[CSML('eqCrossTime'), 'csString'], elems[2]:[CSML('ReferenceableGridCoverage'), 'ReferenceableGridCoverage', CSML('value')], elems[3]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1017        addchildren(self,children)
1018        csElement.__init__(self,**kwargs)
1019       
1020class TrajectoryFeature(AbstractFeature, csElement):
1021    def __init__(self, **kwargs):
1022        AbstractFeature.__init__(self,**kwargs)
1023        elems=['value', 'parameter']
1024        addelems(self,elems)
1025        children={elems[0]:[CSML('TrajectoryCoverage'), 'TrajectoryCoverage', CSML('value')], elems[1]:[CSML('parameter'), 'Phenomenon']}
1026        addchildren(self,children)
1027        csElement.__init__(self,**kwargs)
1028       
1029class FileList(AssociationAttributeGroup,csElement):
1030    def __init__(self,**kwargs):
1031        AssociationAttributeGroup.__init__(self,**kwargs)       
1032        a=['id']
1033        addatts(self,a)
1034        elems=['fileNames']
1035        addelems(self,elems)
1036        children= {elems[0]:[CSML('fileNames'), 'csString']}
1037        addchildren(self,children)
1038        csElement.__init__(self,**kwargs)
1039       
1040class FileExtract(ArrayDescriptor, csElement):
1041    def __init__(self,**kwargs):
1042        ArrayDescriptor.__init__(self,**kwargs)
1043        elems=['fileName', 'fileList', 'fileListXLINK']
1044        addelems(self,elems)
1045        children= {elems[0]:[CSML('fileName'), 'csString'],  elems[1]:[CSML('FileList'), 'FileList', CSML('fileList')],elems[2]:[CSML('fileList'), 'csString']}
1046        addchildren(self,children)
1047        csElement.__init__(self,**kwargs)
1048   
1049class NetCDFExtract(FileExtract, csElement):
1050    def __init__(self,**kwargs):
1051        FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1052        elems=['variableName']
1053        addelems(self,elems)
1054        children={elems[0]:[CSML('variableName'), 'csString']}
1055        addchildren(self,children)
1056        csElement.__init__(self,**kwargs)
1057
1058class NASAAmesExtract(FileExtract, csElement):
1059    def __init__(self,**kwargs):
1060        FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1061        elems=['variableName', 'index']
1062        addelems(self,elems)
1063        children={elems[0]:[CSML('variableName'), 'csString'],elems[1]:[CSML('index'),'csString']}
1064        addchildren(self,children)
1065        csElement.__init__(self,**kwargs)
1066
1067class RawFileExtract(FileExtract, csElement):
1068
1069   # Note: Unlike the other file extracts, this sets a self.dataInterface
1070   # attribute, which is used by the overridden getData to determine which
1071   # Data Interface is used to read the file. This is necessary because the
1072   # getUnknownDataInterface() method determines which DI to use based on
1073   # filename suffix (raw files could be called anything) or by inspecting
1074   # the file (raw files have no magic numbers or other markers that could
1075   # be used to unequivocally determine the file type).
1076   def __init__(self,**kwargs):
1077      FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1078      elems=['endianness', 'fillValue']
1079      addelems(self,elems)
1080      children={elems[0]:[CSML('endianness'), 'csString'],elems[1]:[CSML('fillValue'), 'csString']}
1081      addchildren(self,children)
1082      csElement.__init__(self,**kwargs)
1083      self.dataInterface = csml.csmllibs.csmldataiface.RawFileInterface
1084 
1085class ImageFileExtract(RawFileExtract, csElement):
1086   def __init__(self,**kwargs):
1087      FileExtract.__init__(self, **kwargs)
1088      elems=['fillValue']
1089      addelems(self,elems)
1090      children={elems[0]:[CSML('fillValue'), 'csString']}
1091      addchildren(self,children)
1092      csElement.__init__(self,**kwargs)
1093      self.dataInterface = csml.csmllibs.csmldataiface.ImageFileInterface
1094   
1095
1096class SimpleCondition(csElement): 
1097    '''from moles'''
1098    def __init__(self,**kwargs):
1099        addatts(self, [])
1100        elems= ['dgAttributeAuthority', 'attrauthRole']
1101        addelems(self,elems)
1102        children={elems[0]:[MOLES('dgAttributeAuthority'), 'csString'],elems[1]:[MOLES('attrauthRole'), 'csString']}
1103        addchildren(self,children)
1104        csElement.__init__(self, **kwargs)
1105
1106
1107class ComplexCondition(csElement): 
1108    '''from moles (stub class)'''
1109    def __init__(self,**kwargs):
1110        addatts(self, [])
1111        elems= []
1112        addelems(self,elems)
1113        children={}
1114        addchildren(self,children)
1115        csElement.__init__(self, **kwargs)
1116
1117class DgSecurityCondition(csElement): 
1118    '''from moles'''
1119    def __init__(self,**kwargs):
1120        addatts(self, [])
1121        elems=['effect', 'conditionExplanationText', 'simpleCondition', 'complexCondition']
1122        addelems(self,elems)
1123        children={elems[0]:[MOLES('effect'), 'csString'],elems[1]:[MOLES('conditionExplanationText'),'csString'],elems[2]:[MOLES('simpleCondition'), 'SimpleCondition'],elems[3]:[MOLES('complexCondition'), 'ComplexCondition']}
1124        addchildren(self,children)
1125        csElement.__init__(self,**kwargs)
1126
1127class AccessControlPolicy(csElement):
1128    def __init__(self,**kwargs):
1129        addatts(self,[])
1130        elems=['accessControlPolicyURL', 'accessControlPolicyText', 'dgSecurityCondition']     
1131        addelems(self,elems)
1132        children={elems[0]:[CSML('accessControlPolicyURL'), 'csString'],elems[1]:[CSML('accessControlPolicyText'),'csString'],elems[2]:[CSML('dgSecurityCondition'), 'DgSecurityCondition']}
1133        addchildren(self,children)
1134        csElement.__init__(self,**kwargs)
1135       
1136class CSMLStorageDescriptor(csElement):
1137    def __init__(self,**kwargs):
1138        addatts(self,[])
1139        elems=['descriptors']
1140        addelems(self,elems)
1141        children={elems[0]:[[CSML('NetCDFExtract'),CSML('AggregatedArray'), CSML('RawFileExtract')], 'FileExtract', CSML('descriptor'),1]}
1142        addchildren(self,children)
1143        csElement.__init__(self,**kwargs)
1144
1145class CSMLFeatureCollection(AbstractFeatureCollection,csElement,):
1146    def __init__(self,**kwargs):
1147        AbstractFeatureCollection.__init__(self,**kwargs)
1148        elems=['featureMembers']
1149        addelems(self,elems)
1150        children={elems[0]:[[CSML('GridFeature'), CSML('GridSeriesFeature'),CSML('PointFeature'),CSML('TrajectoryFeature'),CSML('ProfileFeature'),CSML('ProfileSeriesFeature'),CSML('RaggedProfileSeriesFeature'),CSML('RaggedSectionFeature'),CSML('SectionFeature'),CSML('ScanningRadarFeature'),CSML('PointSeriesFeature'),CSML('AlternatePointFeature')], 'AbstractFeature', CSML('featureMember'),1]}
1151        addchildren(self,children)
1152        csElement.__init__(self,**kwargs)
1153    def _getSubstitutionType(self,tag):
1154        if tag==CSML('GridFeature'):
1155            return 'GridFeature'
1156        elif tag==CSML('GridSeriesFeature'):
1157            return 'GridSeriesFeature'
1158        elif tag==CSML('PointFeature'):
1159            return 'PointFeature'
1160        elif tag==CSML('TrajectoryFeature'):
1161            return 'TrajectoryFeature'
1162        elif tag==CSML('PointSeriesFeature'):
1163            return 'PointSeriesFeature'
1164        elif tag==CSML('ProfileFeature'):
1165            return 'ProfileFeature'
1166        elif tag==CSML('ProfileSeriesFeature'):
1167            return 'ProfileSeriesFeature'
1168        elif tag==CSML('RaggedProfileSeriesFeature'):
1169            return 'RaggedProfileSeriesFeature'
1170        elif tag==CSML('RaggedSectionFeature'):
1171            return 'RaggedSectionFeature'
1172        elif tag==CSML('SectionFeature'):
1173            return 'SectionFeature'
1174        elif tag==CSML('ScanningRadarFeature'):
1175            return 'ScanningRadarFeature'
1176        elif tag==CSML('AlternatePointFeature'):
1177            return 'AlternatePointFeature'
1178        else: return 'AbstractFeature'
1179    def _getReverseSubsType(self, typename):
1180        if typename== 'GridFeature':
1181            return CSML('GridFeature')
1182        elif typename == 'GridSeriesFeature':
1183            return CSML('GridSeriesFeature')
1184        elif typename == 'PointSeriesFeature':
1185            return CSML('PointSeriesFeature')
1186        elif typename == 'ProfileFeature':
1187            return CSML('ProfileFeature')
1188        elif typename == 'ProfileSeriesFeature':
1189            return CSML('ProfileSeriesFeature')
1190        elif typename == 'SectionFeature':
1191            return CSML('SectionFeature')
1192        elif typename == 'ScanningRadarFeature':
1193            return CSML('ScanningRadarFeature')
1194        elif typename == 'RaggedSectionFeature':
1195            return CSML('RaggedSectionFeature')
1196        elif typename == 'RaggedProfileSeriesFeature':
1197            return CSML('RaggedProfileSeriesFeature')
1198        elif typename == 'PointFeature':
1199            return CSML('PointFeature')
1200        elif typename == 'TrajectoryFeature':
1201            return CSML('TrajectoryFeature')
1202        elif typename == 'AlternatePointFeature':
1203            return CSML('AlternatePointFeature')
1204        else: return CSML('AbstractFeature')
1205
1206       
1207class Dataset(csElement):   
1208    ''' Dataset class, needed as root of tree'''
1209    def __init__(self, **kwargs):
1210        a=['id']
1211        addatts(self,a)
1212        elems=['name','accessControlPolicy','featureCollection','storageDescriptor']
1213        addelems(self,elems)
1214        children = {elems[0]:[CSML('name') ,'csString'], elems[1]:[CSML('AccessControlPolicy') ,'AccessControlPolicy'], elems[2]:[CSML('CSMLFeatureCollection') ,'CSMLFeatureCollection'],elems[3]:[CSML('CSMLStorageDescriptor'),'CSMLStorageDescriptor']}
1215        addchildren(self,children)
1216        csElement.__init__(self,**kwargs)
1217   
1218    def toXML(self):
1219        csmlfrag=ET.Element(CSML('Dataset'))
1220        csElement.toXML(self, csmlfrag)
1221        return csmlfrag
1222    #def _getSubstitutionType(self,tag): 
1223        #if tag==CSML('NetCDFExtract'):
1224            #return 'NetCDFExtract'
1225        #elif tag==CSML('NASAAmesExtract'):
1226            #return 'NASAAmesExtract'
1227        #else: return 'ArrayDescriptor'
1228    #def _getReverseSubsType(self, typename):
1229        #if typename== 'NetCDFExtract':
1230            #return CSML('NetCDFExtract')
1231        #elif typename == 'NASAAmesExtract':
1232            #return CSML('NASAAmesExtract')
1233        #else: return CSML('ArrayDescriptor')
1234       
1235        return typename
1236
1237   
1238def main():
1239    '''round trip for testing purposes:'''
1240    import parser_extra
1241    print '\n'
1242    #tree=ET.ElementTree(file='/home/dom/coapec/TESTocean.xml')
1243    tree=ET.ElementTree(file='/home/dom/coapec/COAPEC_500YrRun_wholerun_annual_atmos.xml')
1244    import time
1245    time1=time.time()
1246    ds=Dataset()
1247    ds.fromXML(tree.getroot()) 
1248    print 'time=',time.time()-time1
1249    csmltree=ds.toXML()   
1250    csmlout=parser_extra.PrettyPrint(csmltree)
1251    csmlout=parser_extra.removeInlineNS(csmlout)
1252    print 'time=',time.time()-time1
1253    #print '\n %s'% csmlout
1254    #for member in ds.featureCollection.members:
1255      #print dir(member.value)
1256       
1257
1258if __name__=='__main__':
1259    #import profile
1260    #profile.run('main()')
1261    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.