source: TI02-CSML/trunk/csml/csmllibs/csmlcrs.py @ 2317

Subversion URL: http://proj.badc.rl.ac.uk/svn/ndg/TI02-CSML/trunk/csml/csmllibs/csmlcrs.py@2317
Revision 2317, 10.4 KB checked in by domlowe, 13 years ago (diff)

correcting typo

Line 
1import string
2import cdms # just while testing
3
4class CRSystem(object):
5    def __init__(self, srsName, axes):
6        self.srsName=srsName
7        self.axes=axes
8        self.srsDimension=len(self.axes)
9        self.axisLabels=''
10        for axis in self.axes:
11            self.axisLabels=self.axisLabels + axis + ' '
12        self.axisLabels=self.axisLabels[:-1]
13        self.timeAxis=None
14        self.lonAxis=None
15        self.latAxis=None
16
17class CRSCatalogue(object):
18    def __init__(self):
19        # dictionary to hold known CRSystems:
20        self.systems={}
21        self.pseudosystems={}
22       
23        # define lon lat pressure time CRS:       
24        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xypt', axes =['longitude', 'latitude','pressure','time'])
25        crs.lonAxis=0
26        crs.latAxis=1
27        crs.timeAxis=3
28        self.systems['ndg:crs:xypt']=crs
29       
30        # define lon lat height time CRS:       
31        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xyht', axes =['longitude', 'latitude','height','time'])
32        crs.lonAxis=0
33        crs.latAxis=1
34        crs.timeAxis=3
35        self.systems['ndg:crs:xyht']=crs
36       
37        # define lon lat time CRS:
38        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xyt', axes =['longitude', 'latitude','time'])
39        self.systems['ndg:crs:xyt']=crs
40        crs.lonAxis=0
41        crs.latAxis=1
42        crs.timeAxis=2
43       
44        # define lon lat height CRS:
45        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xyh', axes =['longitude', 'latitude','height'])
46        self.systems['ndg:crs:xyh']=crs
47        crs.lonAxis=0
48        crs.latAxis=1
49        crs.timeAxis=None
50       
51       
52        # define height time CRS:
53        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:ht', axes =['height', 'time'])
54        self.systems['ndg:crs:ht']=crs
55        crs.lonAxis=None
56        crs.latAxis=None
57        crs.timeAxis=1
58       
59        #define unknown 3D CRS:
60        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:undefined2d', axes=['tba','tba'])
61        self.pseudosystems['ndg:crs:undefined2d']=crs
62       
63        #define unknown 3D CRS:
64        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:undefinedll3d', axes=['longitude','latitude','tba'])
65        self.pseudosystems['ndg:crs:undefinedll3d']=crs
66        crs.lonAxis=0
67        crs.latAxis=1
68       
69        #define unknown 4D CRS:
70        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:undefinedllt4d', axes=['longitude','latitude','tba','time'])
71        self.pseudosystems['ndg:crs:undefinedllt4d']=crs
72        crs.lonAxis=0
73        crs.latAxis=1
74        crs.timeAxis=3
75       
76       
77        #define unknown 1D CRS:
78        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown', axes=['unknown'])
79        self.systems['ndg:crs:unknown']=crs
80                       
81        #define unknown 3D CRS:
82        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown2d', axes=['unknown','unknown'])
83        self.systems['ndg:crs:unknown2d']=crs
84       
85        #define unknown 3D CRS:
86        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown3d', axes=['unknown','unknown','unknown'])
87        self.systems['ndg:crs:unknown3d']=crs
88       
89        #define unknown 4D CRS:
90        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown4d', axes=['unknown','unknown','unknown','unknown'])
91        self.systems['ndg:crs:unknown4d']=crs
92       
93           
94    def getCRS(self, srsName):
95        #given the name of a CRS e.g. 'ndg:crs:xypt' return the CRSystem object
96        try:
97            return self.systems[srsName]
98        except:
99            if srsName=
100            return self.systems['ndg:crs:unknown']
101   
102    def getUnitType(self, unit):
103        #unittype='unknown'
104        if string.lower(unit) in ['second', 'seconds', 's', 'mins','minute','minutes','hour','hours','h','hr','hrs','day','days']:
105            unittype='time'
106        elif string.lower(unit)[:10] in ['days since', 'seconds si', 'minutes si', 'hours sinc','months sin', 'years sinc']:
107            unittype='time'
108        elif string.lower(unit) in ['mbar', 'pa']:
109            unittype='pressure'
110        elif string.lower(unit) in ['m', 'km']:
111            unittype='height'
112        elif string.lower(unit) in ['degrees_north', 'degrees_south']:
113            unittype='latitude'
114        elif string.lower(unit) in ['degrees_east','degrees_west']:
115            unittype='longitude'
116        else:
117            unittype = unit
118        return unittype
119   
120    def determineCRS(self, axes=None, units=None, knownCRSAxes=None):
121        '''given any list of axis names and a list of units for these axes attempt to determine the CRS and return the CRSystem object and an axis order list.
122        e.g passing in: (axes=['t', 'ht', 'latitude', 'longitude'],units=['days since 1991-09-01 00:00:00', 'm', 'degrees_north', 'degrees_east'])
123        returns self.systems['ndg:crs:xypt'], [3,2,1,0]
124        Assumes the units are ordered to correspond with the axes
125        Alternatively, supply with a list of knownCRSAxes names (e.g. 'latitude', 'longitude', 'height') to get the right crs object       
126        '''
127        import sys               
128        axisorder=[]
129
130        if knownCRSAxes is not None:
131            axes=knownCRSAxes
132        crs =None
133        #if len(axes)==2:
134            #crs=self.systems['ndg:crs:unknown2d']
135        #if len(axes)==3:
136            #crs=self.systems['ndg:crs:unknown3d']
137        #elif len(axes)==4:
138            #crs=self.systems['ndg:crs:unknown4d']
139        #else :
140            #crs=self.systems['ndg:crs:unknown']
141       
142        #this can be extended to accomodate more units       
143        if knownCRSAxes is not None:
144            crsMap=knownCRSAxes         
145        else:
146            crsMap=[]
147            for axis in axes:
148                unit=units[axes.index(axis)]
149                unittype=self.getUnitType(unit)           
150                crsMap.append(unittype)
151           
152       
153        #now try and match up crsMap with known crsystems.       
154        #axisorder stores the order of the supplied axes against the known crs.
155        #so if the known crs is 'Lat' 'Lon' 'Time' and the supplied axes are 'Time' 'Lat' 'Lon' then
156        #axisorder would be [2, 0, 1]         
157        for system in self.systems:
158            if len(self.systems[system].axes) != len(crsMap):
159                #wrong dimensionality, skip this crs
160                continue
161            match=0
162            axisorder={}
163            for ax in self.systems[system].axes:
164                if ax in crsMap:
165                    axisorder[ax]=crsMap.index(ax)
166                else:
167                    match = 1
168                    break
169            if match == 0: 
170                crs=self.systems[system]
171                break
172        if match==1:  #couldn't find a match - generate a pseudo crs   
173            for psystem in self.pseudosystems:
174                if len(self.pseudosystems[psystem].axes) != len(crsMap):
175                    #wrong dimensionality, skip this crs
176                    continue
177                axisorder={}
178                indexes=[]
179                for ax in crsMap:
180                    if ax in self.pseudosystems[psystem].axes:
181                        axisorder[ax]=crsMap.index(ax)
182                        indexes.append(crsMap.index(ax))
183                             
184                if len(axisorder)== len(self.pseudosystems[psystem].axes) - 1:
185                    for ax in enumerate(crsMap):
186                        if ax[1] not in axisorder:
187                            for i in range(3):
188                                if i not in indexes:                               
189                                    axisorder[axes[ax[0]]]=i
190                                    break         
191                               
192                    axisLabels=''                 
193                    orderedNewAxes=[] 
194                    for ax in self.pseudosystems[psystem].axes:
195                        orderedNewAxes.append(ax)
196                    for key in axisorder:
197                        if key in orderedNewAxes:
198                            pass
199                        else:
200                            orderedNewAxes[orderedNewAxes.index('tba')] = key
201
202                    for ax in orderedNewAxes:
203                        axisLabels=axisLabels + ax + ' '         
204                 
205                    crs=CRSystem('ndg:pseudoCRS', orderedNewAxes) #this should be ordered list.
206                    crs.axisLabels=axisLabels
207                    crs.timeAxis=self.pseudosystems[psystem].timeAxis
208                    crs.latAxis=self.pseudosystems[psystem].latAxis
209                    crs.latAxis=self.pseudosystems[psystem].lonAxis
210        return crs, axisorder
211       
212def main():
213    import sys
214    #sys.stdout = open("/home/dom/svn/trunk/csml/testfiles/gridseries/crsout.txt", "w")
215    cat=CRSCatalogue()
216 
217    #test every crs in this netcdf file
218    crsdictionary={}
219    f=cdms.open('/home/dom/svn/trunk/csml/testfiles/gridseries/xaaqda@pxs09c1.nc')
220    for var in f.variables:
221        v=f.variables[var]
222        axes=v.getAxisIds()
223        units =[]
224        for axis in axes:
225            ax=f.getAxis(axis)
226            units.append(ax.attributes['units'])
227        crsdictionary[str(axes)]=units
228    n=0
229    #test each definition in dictionary
230       
231    for key in crsdictionary:
232        n=n+1
233        print '\n TEST %d'%n
234        print '*************************************'
235        #make list from string.
236        axs=[]
237        for item in key.split():
238            axs.append(item)
239        axs=eval(key)
240        uns=crsdictionary[key]
241        print 'AXES: %s'%axs
242        print 'UNITS: %s'%uns
243        print '----------------------------'
244        crs, axisorder= cat.determineCRS(axes=axs, units=uns)
245        #print 'CRS: %s'%crs.srsName
246        print 'ORDER:  %s'%axisorder
247        print 'LABELS: %s'%crs.axisLabels
248        print 'CRS AXES: %s'%crs.axes
249        labels=''
250       
251       
252        for axis in axes:
253            labels=labels + axis + ' '
254       
255        #print '\n Pseudo CSML:'
256        #print '<GridSeriesDomain srsName=%s srsDimension=%s axisLabels=%s>'%(crs.srsName, crs.srsDimension,crs.axisLabels)
257        #print '<axisLabels>%s</axisLabels>'%labels
258        #for axis in axes:
259            #print '<GridOrdinate>'
260            #unit=units[axes.index(axis)]
261            #print '     <coordAxisLabel>%s</coordAxisLabel>'%crs.axes[axisorder[axes.index(axis)]]
262            #print '     <gridAxesSpanned>%s</gridAxesSpanned>'%axis
263            #print '</GridOrdinate>'
264        #print '</GridSeriesDomain>'
265       
266        #print '**************************************'
267   #test getting CRS by name:
268    #print 'getting ndg:crs:xypt by name'
269    #crs=cat.getCRS('ndg:crs:xypt')
270    #print 'returns %s'%crs.srsName
271       
272   
273if __name__=="__main__":
274    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.