source: TI02-CSML/trunk/csml/csmllibs/csmlcrs.py @ 2176

Subversion URL: http://proj.badc.rl.ac.uk/svn/ndg/TI02-CSML/trunk/csml/csmllibs/csmlcrs.py@2176
Revision 2176, 6.9 KB checked in by domlowe, 13 years ago (diff)

Numeric.array is now the standard data container

Line 
1import string
2import cdms # just while testing
3
4class CRSystem(object):
5    def __init__(self, srsName, axes):
6        self.srsName=srsName
7        self.axes=axes
8        self.srsDimension=len(self.axes)
9        self.axisLabels=''
10        for axis in self.axes:
11            self.axisLabels=self.axisLabels + axis + ' '
12        self.axisLabels=self.axisLabels[:-1]
13        self.timeAxis=None
14        self.lonAxis=None
15        self.latAxis=None
16
17class CRSCatalogue(object):
18    def __init__(self):
19        # dictionary to hold known CRSystems:
20        self.systems={}
21       
22        # define lon lat pressure time CRS:       
23        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xypt', axes =['longitude', 'latitude','pressure','time'])
24        crs.lonAxis=0
25        crs.latAxis=1
26        crs.timeAxis=3
27        self.systems['ndg:crs:xypt']=crs
28       
29        # define lon lat height time CRS:       
30        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xyht', axes =['longitude', 'latitude','height','time'])
31        crs.lonAxis=0
32        crs.latAxis=1
33        crs.timeAxis=3
34        self.systems['ndg:crs:xyht']=crs
35       
36        # define lon lat time CRS:
37        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:xyt', axes =['longitude', 'latitude','time'])
38        self.systems['ndg:crs:xyt']=crs
39        crs.lonAxis=0
40        crs.latAxis=1
41        crs.timeAxis=2
42       
43        #define unknown 1D CRS:
44        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown', axes=['unknown'])
45        self.systems['ndg:crs:unknown']=crs
46       
47        #define unknown 3D CRS:
48        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown2d', axes=['unknown','unknown'])
49        self.systems['ndg:crs:unknown2d']=crs
50       
51        #define unknown 3D CRS:
52        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown3d', axes=['unknown','unknown','unknown'])
53        self.systems['ndg:crs:unknown3d']=crs
54       
55        #define unknown 4D CRS:
56        crs=CRSystem(srsName='ndg:crs:unknown4d', axes=['unknown','unknown','unknown','unknown'])
57        self.systems['ndg:crs:unknown4d']=crs
58       
59           
60    def getCRS(self, srsName):
61        #given the name of a CRS e.g. 'ndg:crs:xypt' return the CRSystem object
62        try:
63            return self.systems[srsName]
64        except:
65            return self.systems['ndg:crs:unknown']
66   
67    def determineCRS(self, axes, units):
68        '''given any list of axis names and a list of units for these axes attempt to determine the CRS and return the CRSystem object and an axis order list.
69        e.g passing in: (axes=['t', 'ht', 'latitude', 'longitude'],units=['days since 1991-09-01 00:00:00', 'm', 'degrees_north', 'degrees_east'])
70        returns self.systems['ndg:crs:xypt'], [3,2,1,0]
71        Assumes the units are ordered to correspond with the axes!
72        '''
73        axisorder=[]
74        if len(axes)==2:
75            crs=self.systems['ndg:crs:unknown2d']
76        if len(axes)==3:
77            crs=self.systems['ndg:crs:unknown3d']
78        elif len(axes)==4:
79            crs=self.systems['ndg:crs:unknown4d']
80        else :
81            crs=self.systems['ndg:crs:unknown']
82        crsMap=[]
83        #this can be extended to accomodate more units
84        for axis in axes:
85            unit=units[axes.index(axis)]
86            unittype='unknown'
87            if string.lower(unit) in ['second', 'seconds', 's', 'mins','minute','minutes','hour','hours','h','hr','hrs','day','days']:
88                unittype='time'
89            elif string.lower(unit)[:10] in ['days since', 'seconds si', 'minutes si', 'hours sinc','months sin', 'years sinc']:
90                unittype='time'
91            elif string.lower(unit) in ['mbar', 'pa','level']:
92                unittype='pressure'
93            elif string.lower(unit) in ['m', 'km']:
94                unittype='height'
95            elif string.lower(unit) in ['degrees_north', 'degrees_south']:
96                unittype='latitude'
97            elif string.lower(unit) in ['degrees_east','degrees_west']:
98                unittype='longitude'
99            crsMap.append(unittype)
100       
101        #now try and match up crsMap with known crsystems.       
102        #axisorder stores the order of the supplied axes against the known crs.
103        #so if the known crs is 'Lat' 'Lon' 'Time' and the supplied axes are 'Time' 'Lat' 'Lon' then
104        #axisorder would be [2, 0, 1] 
105       
106        for system in self.systems:
107            if len(self.systems[system].axes) != len(crsMap):
108                #wrong dimensionality, skip this crs
109                continue
110            match=0
111            axisorder={}
112            for ax in self.systems[system].axes:
113                if ax in crsMap:
114                    axisorder[ax]=crsMap.index(ax)
115                else:
116                    match = 1
117                    break
118            if match == 0: 
119                crs=self.systems[system]
120                break
121                       
122        return crs, axisorder
123       
124def main():
125    import sys
126    sys.stdout = open("/home/dom/Desktop/SVN/trunk/csml/testfiles/gridseries/crsout.txt", "w")
127    cat=CRSCatalogue()
128 
129    #test every crs in this netcdf file
130    crsdictionary={}
131    f=cdms.open('/home/dom/Desktop/SVN/trunk/csml/testfiles/gridseries/xaaqda@pxs19c1.nc')
132    for var in f.variables:
133        v=f.variables[var]
134        axes=v.getAxisIds()
135        units =[]
136        for axis in axes:
137            ax=f.getAxis(axis)
138            units.append(ax.attributes['units'])
139        crsdictionary[str(axes)]=units
140    n=2
141    #test each definition in dictionary
142    for key in crsdictionary:
143        n=n+1
144        print '\n TEST %d'%n
145        print '*************************************'
146       #make list from string.
147        axs=[]
148        for item in key.split():
149            axs.append(item)
150        uns=crsdictionary[key]
151        print 'AXES: %s'%axs
152        print 'UNITS: %s'%uns
153        crs, axisorder= cat.determineCRS(axes=axs, units=uns)
154        print 'CRS: %s'%crs.srsName
155        print 'ORDER:  %s'%axisorder
156        #print 'axis order =%s'%axisorder
157        labels=''
158       
159        #print axes
160        # ['t', 'ht', 'latitude_1', 'longitude_1']
161        #print crs.axes
162         # ['Lon', 'Lat', 'Pressure', 'Time']
163        #print axisorder
164        # [3, 2, 1, 0]
165       
166        for axis in axes:
167            labels=labels + axis + ' '
168       
169        #print '\n Pseudo CSML:'
170        #print '<GridSeriesDomain srsName=%s srsDimension=%s axisLabels=%s>'%(crs.srsName, crs.srsDimension,crs.axisLabels)
171        #print '<axisLabels>%s</axisLabels>'%labels
172        #for axis in axes:
173            #print '<GridOrdinate>'
174 
175            #unit=units[axes.index(axis)]
176           # print '     <coordAxisLabel>%s</coordAxisLabel>'%crs.axes[axisorder[axes.index(axis)]]
177          #  print '     <gridAxesSpanned>%s</gridAxesSpanned>'%axis
178         #   print '</GridOrdinate>'
179        #print '</GridSeriesDomain>'
180       
181        print '**************************************'
182   #test getting CRS by name:
183    #print 'getting ndg:crs:xypt by name'
184    #crs=cat.getCRS('ndg:crs:xypt')
185    #print 'returns %s'%crs.srsName
186       
187   
188if __name__=="__main__":
189    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.